De la regulation de la transcription a l'hepatocarcinogenese : les facteurs nucleaires hnf1 et hnf4

From transcriptional regulation to hepatocarcinogenesis : transcription factors hnf1 and hnf4

• Auteur / Autrice : François Ringeisen
• Direction : Moshe Yaniv
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

La famille des homeoproteines hnf1 (hepatocyte nuclear factor 1) et vhnf1 (variant hnf1) compte de multiples isoformes identifiees dans differents organismes, qui sont susceptibles de fixer une meme sequence d'adn sous forme d'homo- ou d'heterodimeres. Les proteines vhnf1a et vhnf1b different par une sequence de vingt-six acides amines situee en amont de l'homeodomaine. Nous avons montre que cette region augmente l'affinite du facteur vhnf1a pour sa sequence cible. Les deux isoformes contiennent le meme domaine transactivateur mais vhnf1a possede une capacite plus forte d'activation de la transcription. Une des difficultes de l'etude de la fonction d'un facteur de transcription est la mise en evidence des genes cibles. Connaissant la sequence des sites de fixation pour hnf1 d'une vingtaine de genes, nous avons defini une matrice qui permet d'attribuer a toutes sequences de quinze nucleotides une valeur predictive de sa capacite de fixation pour hnf1. A l'aide d'un algorithme, nous avons identifie dans les banques de sequences plusieurs centaines de nouveaux sites potentiels pour hnf1. Nous avons verifie in vitro la capacite de fixation effective d'une cinquantaine de ces sites. L'infection chronique de marmottes par le virus whv (woodchuck hepatitis virus) est constamment suivie par le developpement d'hepatocarcinomes. L'activation de l'oncogene n-myc2 par l'integration de sequences virales constitue un evenement clef dans la transformation tumorale. Nous avons identifie un element regulateur de l'expression du virus whv, denomme we2. Il contient des sites de fixation pour les facteurs de transcription hepatiques hnf1 et hnf4 qui sont les principaux determinants de son activite. We2 controle l'expression de l'arn pregenomique viral. Il est egalement capable d'activer le promoteur heterologue du gene n-myc2. Enfin, nous avons mis en evidence dans la region centrale de we2 des differences entre le virus whv et le virus homologue gshv (ground squirrel hepatitis virus).