Stabilisation de triple-helices par des ligands specifiques

Stabilization of triple helices by specific ligands

• Auteur / Autrice : Christophe Escudé
• Direction : Thérèse Garestier-Hélène
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées. Psychologie. Sciences médicales
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Des oligonucleotides naturels ou modifies peuvent se fixer dans le grand sillon de l'adn pour former une triple helice intermoleculaire. Une telle structure peut etre utilisee pour moduler l'expression des genes ou concevoir des outils de biologie moleculaire. Plusieurs types de triple-helices peuvent etre observes, dans des conditions rigoureuses de ph et d'environnement ionique. Certains derives des benzopyridoindoles (bpi) se fixent sur les triple-helices comportant des troisiemes brins (t,c) et les stabilisent. Une etude systematique de l'influence de ces derives sur plusieurs types de sequences a permis de proposer un modele d'intercalation des bpi dans ces triple-helices. Ce modele a montre que les interactions d'empilement des bpi avec les triplets de bases faisait surtout intervenir les bases appariees par les liaisons hydrogenes de type hoogsteen, ce qui a conduit a deux observations interessantes. Tout d'abord, nous avons montre que les bpi sont capables d'induire l'appariement de deux oligonucleotides paralleles complementaires au sens de hoogsteen. Ensuite, nous avons propose la structure de nouvelles molecules qui permettraient de meilleures interactions avec les trois brins de la triple-helice. De telles molecules, les benzoquinoquinoxalines, ont ete synthetisees et evaluees. Elles constituent les meilleurs ligands des triple-helices actuellement connus. Les benzopyridoindoles sont capables d'induire la fixation d'oligonucleotides antiparalleles composes de g et t, mais pas de g et a. Certains derives possedent des proprietes photochimiques qui pourraient etre utilisees pour determiner les sites d'interaction avec les triple-helices. Ces etudes definissent pour chaque type de triple-helice le ligand le plus adapte, et donnent une idee des mecanismes d'interaction mis en jeu. Elles permettent d'envisager l'etude de l'influence de la formation d'une triple helice inter- et intramoleculaire sur la transcription d'un gene en presence de ligand