Succès épidémiologique et contrôle du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum à Madagascar et dans le sud-ouest de l'océan indien

Epidemiological success and control of Ralstonia solanacearum species complex in Madagascar and in the southwest of Indian Ocean

• Auteur / Autrice : Marie veronique Nomenjanahary
• Direction : Stéphane Poussier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie des organismes
• Date : Soutenance le 17/12/2024
• Etablissement(s) : La Réunion
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences, Technologies et Santé (Saint-Denis, La Réunion ; 2010-...)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (Saint-Pierre, Réunion) - Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical
• Jury : Président / Présidente : Isabelle Fock-Bastide
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Isabelle Fock-Bastide, Christophe Lemaire, Alice Guidot, Sébastien Cunnac
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Christophe Lemaire, Alice Guidot
• DOI : 10.70675/f7f2bf43zb86dz4f14z8679z2005dea51c75

Mots clés

Mots clés contrôlés

Ralstonia solanacearum

Indien (îles du sud-ouest de l'océan)

Épidémiologie

Mots clés libres

Epidémiologie

Complexe d'espèces Ralstonia solanacearum

Sud-Ouest de l'océan indien

Epidemiology

Ralstonia solanacearum species complex

Southwest Indian Ocean

Résumé

Le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) est l'agent responsable du flétrissement bactérien, et constitue une contrainte biotique majeure sur les systèmes de cultures maraîchères, fruitières, ornementales et forestières dans toute la ceinture tropicale, subtropicale, de plaine et d'altitude. Il est structuré phylogénétiquement en quatre phylotypes (I, II, III et IV). Les diverses prospections faites dans la zone du sud-ouest de l'Océan Indien (SOOI) aux travers de divers travaux de recherche suggèrent que ces quatre phylotypes se sont installés dans la zone. Néanmoins, leur prévalence diffère considérablement. Ce projet de thèse vise à comprendre les bases moléculaires du succès épidémiologique des lignées prévalentes à Madagascar et dans le SOOI, en comparaison des autres lignées, afin d'évaluer l'efficacité et la durabilité de la résistance d'une accession d'aubergine pour les contrôler. Pour ce faire, les deux axes suivants seront menés en parallèle durant toute la durée de la thèse. En axe 1, les mécanismes moléculaires mis en place par la bactérie pour s'adapter à son hôte et son environnement seront identifiés puis comparés entre lignées très et peu prévalentes. En axe 2, plusieurs accessions d'aubergine seront testées vis-à-vis des lignées très prévalentes afin d'évaluer leur niveau de résistance et les risques de contournement.

The Ralstonia solanacearum species complex (Rssc) is the causal agent of bacterial wilt, and is one of the major biotic constraint on vegetable, fruit, ornamental and forestry crop systems throughout the tropical, subtropical, lowland and highland belt. It is phylogenetically structured in four phylotypes (I, II, III and IV). The various surveys carried out in the Southwest Indian Ocean (SOOI) zone through different research works suggest that these four phylotypes have settled in the zone. Nevertheless, their prevalence differs considerably. This thesis project aims to understand the molecular basis of the epidemiological success of the prevalent lines in Madagascar and in the SOOI, in comparison with the other lines, in order to evaluate the efficiency and durability of the resistance of an eggplant accession to control them. In that respect, the following two axes will be conducted in parallel during the duration of the thesis. In axis 1, the molecular mechanisms put in place by the bacterium to adapt to its host and environment will be identified and compared between highly and less prevalent lines. In axis 2, several eggplant accessions will be tested against highly prevalent lines in order to evaluate their level of resistance and the risks of bypassing them.