Evaluation de l’efficacité d’alternatives alimentaires fonctionnelles pour lutter contre l’infection à Aeromonas, principalement Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida : Vers la réduction de l’utilisation d’antibiotiques pour diminuer le développement et la diffusion de bactéries et de gènes résistants aux antibotiques chez les poissons et l’environnement

Evaluation the efficacy of the functional feed alternatives to control Aeromonas infection, mainly Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida : towards reduction in antibiotic use to decrease the development and diffusion of antibiotic-resistant bacteria and genes in fish and environment

• Auteur / Autrice : Niki Hayatgheib
• Direction : Hervé Pouliquen, Didier Lepelletier, Emmanuelle Moreau
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Santé animale - One Health
• Date : Soutenance le 07/07/2021
• Etablissement(s) : Nantes, Ecole nationale vétérinaire
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Ecologie, Géosciences, Agronomie et Alimentation
• Jury : Président / Présidente : Nathalie Caroff
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Hervé Pouliquen, Didier Lepelletier, Emmanuelle Moreau, Nathalie Caroff, Brigitte Lamy, Ségolène Calvez, Pascal Sanders
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Nathalie Caroff, Samira Sarter

Mots clés

Mots clés libres

Aeromonas

Bactéries résistantes aux antibiotiques

Poisson

Alternatives alimentaires fonctionnelles

Environnement

Gènes de résistance

Aeromonas

Antibiotic-resistant bacteria

Fish

Functional feed alternatives

Environment

Resistance genes

Résumé

Des alternatives fonctionnelles à base de prébiotiques et d’huiles essentielles (PEA) contre la furonculose due à Aeromonas salmonicida subsp salmonicida (ASS) sont envisagées pour réduire l'utilisation d'antibiotiques et peut-être les bactéries résistantes aux antibiotiques (ARB) et les gènes de résistances (ARG). Les résultats in vitro ont montré une activité antibactérienne efficace du PEA par la méthode de microdilution. Pendant 11 semaines d'une étude in vivo sur 600 truites arc-en-ciel (TAC), le PEA a amélioré quelques paramètres d'immunité, la prise vaccinale, la protection des poissons contre l'infection ASS ainsi que les performances de croissance après l'inoculation ASS, mais l'augmentation de la résistance à la maladie n'a pas été observée. Une étude de sept mois sur deux fermes de TAC n'a pas montré l'effet protecteur du PEA sur l'une des fermes atteints de furonculose dans laquelle un traitement antibiotique a été effectué. Des échantillons de poissons, d'eaux et de biofilms provenant de ces fermes ont révélé que l'occurrence et l'abondance des ARB et ARG dépendaient de l'origine d'Aeromonas, de l'utilisation d'antibiotiques et de la présence d'activités en amont. Le lien entre les poissons et leur environnement par la détection identiques d'ARB et d'ARG ainsi qu'un risque élevé de développement d'ARB et d'ARG dans les milieux aquatiques ont été observés. Les résultats de ces études ont montré jusqu'où il convient encore aller dans le développement d'alternatives efficaces pour réduire l'utilisation d'antibiotiques ainsi que diminuer la transmission généralisée d’ARB et d’ARG dans l'écosystème aquatique en lien avec l'homme et l’animal.

Application of functional feed alternatives based on prebiotics and essential oils additive (PEA) to control furunculosis due to Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida Aeromonas (ASS) is considered to reduce antibiotic use and perhaps antibiotic-resistant bacteria (ARB) and genes (ARG) in fish and environment. This study evaluated the efficacy of PEA against ASS through in vitro, in vivo and on-farm studies. In vitro results showed efficient antibacterial activity of PEA through micro dilution method. During 11 weeks of an in vivo study on 600 rainbow trout, PEA enhanced few immunity parameters, improved vaccine uptake and fish protection from ASS infection as well as growth performance after ASS inoculation, but the increase of disease resistance was not observed. A seven-months study on two rainbow trout farms did not show the protection effect of PEA on one of the farm detected with furunculosis into which antibiotic treatment was done. Fish, water and biofilm samples from these farms revealed that occurrence and abundance of ARB and ARG depended on Aeromonas origin, antibiotic use and presence of upstream activities. The link between fish and their environment by the detection of identical ARB and ARGs as well as a high risk of resistance genes developing and spreading in aquatic environments were observed. These collective facts from in vitro, in vivo and on-farm studies showed how far we still have to go in developing an efficient and practical alternative functional feed to reduce antibiotic use as well as decrease widespread transmission of Aeromonas ARB and ARGs in aquatics ecosystem relating to human and various animal species.