Cyanobactéries diazotrophes du Pacifique Sud : variabilité saisonnière, caractérisation morpho-génétique/chimique et potentiel de valorisation

South Pacific diazotrophic cyanobacteria : seasonal variability, morphogenetic / chemical characterization and potential for upgrading

• Auteur / Autrice : Emmrick André Saulia
• Direction : Sophie Bonnet, Édouard Hnawia
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
• Date : Soutenance le 29/04/2019
• Etablissement(s) : Nouvelle Calédonie
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale du Pacifique (Faaa ; 2005-....)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Institut méditerranéen d'océanologie (Marseille ; Toulon ; 2012-....) - Institut de recherche pour le développement (France). Centre de Nouméa - Centre hospitalier territorial Gaston-Bourret (Nouméa)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de biophysique moléculaire (Orléans ; 1967-....) - National University of Ireland. Center for Irish Studies (Galway, Irlande) - Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie
• Jury : Président / Présidente : Fabrice Colin
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Fabrice Colin, Cécile Dupouy, Olivier Paul Thomas, Nicolas Lebouvier
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Cécile Dupouy, Olivier Paul Thomas

Mots clés

Mots clés contrôlés

Biotechnologie

Innovation

Chimie pharmaceutique

Nouvelle-Calédonie

Phytoplancton marin

Bactéries fixatrices d'azote

Pacifique (océan ; sud-est)

Cyanobactéries

Mots clés libres

Caractérisation génétique, protéomique

Océan Pacifique sud-ouest

Valorisation

Caractérisation génétique, protéomique

Diazotrophic cyanobacteria

Southwest Pacific Ocean

Valuation

Genetic characterization, proteomics

Résumé

L'Océan Pacifique sud-ouest et les eaux de la Nouvelle-Calédonie sont caractérisés par de fortes abondances en cyanobactéries. Parmi ces cyanobactéries, certaines ont la capacité de fixer l'azote atmosphérique (N2), et sont appelées cyanobactéries diazotrophes. Ces organismes sont connus pour contenir en proportions variables des métabolites et nutriments à haute valeur ajoutée qui leur confèrent un potentiel de valorisation économique possiblement intéressants pour la Nouvelle-Calédonie. Plusieurs de ces cyanobactéries ont été isolées en culture depuis les eaux côtières et hauturières du Pacifique·Sud-Ouest mais la caractérisation précise de leur diversité et de leur potentiel de valorisation restent encore inconnus. Dans l 'optique d'une meilleure connaissance de la diversité et d'une éventuelle valorisation économique, les objectifs de ce travail doctoral étaient (i) d'étudier la variabilité saisonnière de la diversité/activité des cyanobactéries diazotrophes dans le lagon de Nouméa, (i) d'effectuer une caractérisation morpho-génétique et protéomique de souches autochtones récemment isolées en culture et (iii) d'évaluer leurs potentiels de valorisation.

The southwest Pacific Ocean and the waters of New Caledonia are characterized by high abundances of cyanobacteria. Among these cyanobacteria, some have the ability to fix atmospheric nitrogen (N2), and are called diazotrophic cyanobacteria. These organisms are known to contain high added value metabolites and nutrients in varying proportions, which give them potential for economic development that may be of interest to New Caledonia. Several of these cyanobacteria have been isolated in culture from the coastal and offshore waters of the Southwest Pacific, but the precise characterization of their diversity and their potential for recovery are still unknown. With a view to a better knowledge of diversity and a possible economic valuation, the objectives of this doctoral work were (i) to study the seasonal variability of the diversity / activity of diazotrophic cyanobacteria in the lagoon of Noumea, (i) to carry out a morphogenetic and proteomic characterization of indigenous strains recently isolated in culture and (iii) to evaluate their potential for valorization.