Régulation de l’excitabilité musculaire par le canal potassique EGL-23 et la voie de signalisation LIN-12/Notch chez le nématode C. elegans

Regulation of muscle excitability by the potassium channel EGL-23 and the LIN-12/Notch pathway in the nematode Caenorhabditis elegans

• Auteur / Autrice : Sonia El Mouridi
• Direction : Thomas Boulin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire. Génétique. Neurobiologie
• Date : Soutenance le 18/10/2018
• Etablissement(s) : Lyon
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale de Biologie Moléculaire Intégrative et Cellulaire (Lyon)
• Partenaire(s) de recherche : établissement opérateur d'inscription : Université Claude Bernard (Lyon ; 1971-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut NeuroMyoGène (Lyon ; 2016-2021)
• Jury : Président / Présidente : Jean-Louis Bessereau
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Thomas Boulin, Delphine Bichet
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Sophie Jarriault, Jean-Marc Goaillard

Mots clés

Mots clés contrôlés

Canaux potassiques

Caenorhabditis elegans

Mots clés libres

C. elegans

CRISPR/Cas9

Canaux potassiques K2P

EGL-23

Voie de signalisation LIN-12/Notch

C. elegans

CRISPR/Cas9

K2P channel

EGL-23

LIN-12/Notch signaling

Résumé

Les canaux potassiques à deux domaines pore (K2P) sont des régulateurs principaux de l’excitabilité cellulaire car ils jouent un rôle central dans l’établissement et le maintien du potentiel de repos des cellules animales. Malgré leur rôle fondamental, peu d’informations sont connues sur les processus cellulaires qui contrôlent la fonction des canaux K2P in vivo. En particulier, nous ne connaissons que quelques facteurs qui contrôlent directement le nombre, l’activité et la localisation des K2P à la surface des cellules.Durant ma thèse, j’ai utilisé des stratégies d’ingénierie du génome que j’ai associé à des approches génétiques afin de caractériser le canal potassique EGL-23. Pour cela, j’ai réalisé un crible suppresseur du phénotype de défaut de ponte du mutant egl-23(n601) et un crible visuel sur le rapporteur fluorescent traductionnel egl-23::TagRFP-T. Grâce au reséquençagecomplet du génome, j’ai pu cloner 4 gènes impliqués dans la régulation du canal EGL-23.

Two-pore domain potassium channels (K2P) are major regulators of cell excitability, playing a central role in the establishment and maintenance of the resting potential of animal cells. Despite their fundamental role, little is known about the cellular processes that control K2P channels function in vivo. In particular, we know only few factors that directly control thenumber, activity, and localization of K2P on the cell surface.During my thesis, I used state-of-the art genome engineering technologies combined with genetic approaches to characterize the C. elegans potassium channel EGL-23. For this, I realized a phenotypic suppressor screen of the egg-laying defective mutant egl-23(n601) and a visual screen on an egl-23 translational fluorescent reporter. Using whole genome sequencing, I was able to clone for new genes involved in EGL-23 regulation