Caractérisation moléculaire intraspécifique et phylogénie comparée de deux Betacoronavirus de clade A : HCoV-OC43 et BCoV

par Nathalie Kin

Thèse de doctorat en Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Sous la direction de Astrid Vabret.


  • Résumé

    Les coronavirus sont caracterises par un potentiel evolutif important par l’intermediaire de recombinaisons genetiques et de mutations ponctuelles. Ces evenements peuvent avoir pour consequences l’emergence reussie d’un nouveau variant dans une nouvelle population hote, apres un franchissement de barriere d’espece. L’un de ces franchissement inter-especes a eu lieu a la fin du xixeme siecle avec l’emergence du hcov-oc43 a partir du bcov. Le genotypage du hcov-oc43 a permis de mettre en evidence une diversification intraspecifique en de nombreux genotypes incluant des genotypes recombinants. Parallelement, le genotypage du bcov n’a pas permis d’observer d’evenements de recombinaisons. Cependant, nous avons observe une organisation des bcov selon une distribution geographique avec un cluster amerique/asie et un cluster europe. L’emergence d’un coronavirus dans la population humaine a partir d’un reservoir animal doit faire l’objet d’une surveillance, comme le montre l’emergence du sars-cov et le mers-cov, a l’origine d’epidemies associees a des mortalites globales d’environ 10% et 40% respectivement.

  • Titre traduit

    Intraspecific molecular characterization and compared phylogeny of two clade A Betacoronaviruses : HCoV-OC43 and BCoV


  • Résumé

    Coronaviruses are characterized by an important evolutionary potential by genetic recombination and single nucleotide polymorphisms. These events could lead to the successful emergence of a new variant in a new host population, following a species barrier crossing. One such event occurred at the end of the 19th century, with the emergence of hcov-oc43 from bcov. Genotyping of hcov-oc43 has made it possible to show an intraspecific diversification into numerous genotypes, including recombinant variants. In parallel, genotyping of bcov did not reveal recombinant events. However, we observed an organization of bcov with a geographical distribution, with a european cluster and an american/asian cluster. There is a need for monitoring the emergence of coronaviruses in the human population from an animal reservoir, such as has been seen in the emergence of sars-cov and mers-cov at the origin of epidemics associated with global mortality rates of around 10% and 40%, respectively.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (250 f.)
  • Annexes : Bibliogr. 460 ref. Index

Où se trouve cette thèse\u00a0?

  • Bibliothèque : Université de Caen Normandie. Bibliothèque Rosalind Franklin (Sciences-STAPS).
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TCAS-2015-68
  • Bibliothèque : Université de Caen Normandie. Bibliothèque Rosalind Franklin (Sciences-STAPS).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TCAS-2015-68bis

Cette version existe également sous forme de microfiche :

  • Bibliothèque : Université de Lille. Service commun de la documentation. Bibliothèque universitaire de Sciences Humaines et Sociales.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : 2015CAEN2068
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.