Recherche d'inhibiteurs naturels des protéines anti-apoptotiques Bcl-xL et Mcl-1

par Charlotte Geny

Thèse de doctorat en Chimie

Sous la direction de Marc Litaudon et de Vincent Dumontet.

Soutenue le 24-10-2014

à Paris 11 , dans le cadre de Ecole doctorale Innovation Thérapeutique : du Fondamental à l'Appliqué (2000-2015 ; Châtenay-Malabry, Haut-de-Seine) , en partenariat avec Institut de chimie des substances naturelles (Gif-sur-Yvette, Essonne) (laboratoire) et de Institut de Chimie des Substances Naturelles (laboratoire) .


  • Résumé

    Dans le but de rechercher des inhibiteurs naturels des protéines anti-Apoptotiques Bcl-XL et Mcl-1, deux essais biologiques ont été mis au point sur Bcl-XL/Bak-CF et Mcl-1/Bid-CF. Ces deux tests utilisent la polarisation de fluorescence et sont basés sur la liaison d’un peptide pro-Apoptotique marqué à la fluorescéine (Bak-CF ou Bid-CF) avec une protéine anti-Apoptotique (Bcl-XL ou Mcl-1). Au total, près de 600 extraits de pantes, provenant de diverses régions du monde, ont été criblés sur les deux protéines Bcl-XL et Mcl-1 permettant de sélectionner les extraits acétate d’éthyle des écorces de Knema hookeriana (Myristicaceae) et de Fissistigma latifolium (Annonaceae). L’analyse chimique des constituants des écorces de K. hookeriana a conduit à l’isolement de 12 lipides phénoliques dont 6 n’avaient jamais été isolés d’un organisme vivant. Seuls les acides anacardiques ont révélé de très fortes inhibitions de l’interaction Bcl-XL/Bak-CF et Mcl-1/Bid-CF dans les essais par polarisation de fluorescence. Une étude plus approfondie des interactions entre le plus actif des produits et les protéines (Bcl-XL, Mcl-1, Bak et Bid) par RMN, a montré que la modulation des interactions Bcl-XL/Bak et Mcl-1/Bid n’est pas liée à l’affinité de l’acide anacardique pour les protéines Bcl-XL et Mcl-1 mais a une forte affinité pour les peptides Bid et Bak. Le fractionnement bioguidé de l’extrait AcOEt des écorces de F. latifolium a conduit à l’isolement d’une nouvelle chalcone prénylée, la (±)-Écarlottone possédant une dual activité sur les protéines, Bcl-XL et Mcl-1. Par la suite, le fractionnement "RMN-Guidé" a mené à l’isolement de 6 analogues.

  • Titre traduit

    Search for natural inhibitors of the anti-apoptotic proteins Bcl-xL and Mcl-1


  • Résumé

    In order to search for natural inhibitors of anti-Apoptotic protein Bcl-XL and Mcl-1, two bioassays were developed on Bcl-XL/Bak-CF and Mcl-1/Bid-CF. Both assays use fluorescent polarisation, and are based on binding of a fluorescein labeled pro-Apoptotic peptide (Bak-CF or-CF Bid) with an anti-Apoptotic protein (Bcl-XL or Mcl-1). Nearly 600 extracts from various parts of the world were screened on both Bcl-XL and Mcl-1 proteins to select the ethyl acetate bark extracts of Knema hookeriana (Myristicaceae) and Fissistigma latifolium (Annonaceae). The chemical analysis of the constituents of K. hookeriana has led to the isolation of 12 phenolic lipids. 6 of them were never isolated from a living organism. Only anacardic acids showed very strong inhibition of the interaction Bcl-XL/Bak-CF and Mcl-1/Bid-CF in fluorescent polarisation assays. Further study of the interactions between the most active anacardic acid and proteins (Bcl-XL, Mcl-1, Bak and Bid) by NMR showed that the modulation of Bcl-XL/Bak and Mcl-1/Bid is not related to the affinity of the compoun to the anti-Apoptotic proteins, Bcl-XL and Mcl-1 but to its affinity for peptides, Bid and Bak. The bioguided fractionation of the AcOEt bark extract of F. latifolium led to the isolation of a novel prenylated chalcone, (±)-Écarlottone having a dual activity on protein, Bcl-XL and Mcl-1. Subsequently, fractionation "NMR-Guided" led to the isolation of 6 new analogs.


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