Bases moléculaires de la sélectivité d'intégration du rétrotransposon Ty1 en amont des gènes transcrits par l'ARN Polymérase III

• Auteur / Autrice : Antoine Bridier
• Direction : Pascale Lesage
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biothérapies et Biotechnologie
• Date : Soutenance en 2014
• Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bases de données chimiques

RNA polymerase III

Rétroéléments

Levures

Integrases

Résumé

Mobile genetic elements are ubiquitous and dynamic components of genomes, and their integration site choice influences genome stability and gene expression. The Tyl retrotransposon of the yeast Saccharomyces cerevisiae is closely related to retroviruses and replicates by reverse transcribing its genomic RNA into cDNA, which is then integrated into the host cell genome. Tyl integrates upstream of RNA polymerase III (Pol III)-transcribed genes, yet, the primary determinant of target specificity has remained elusive. Here, we describe a functional interaction between Tyl integrase and the AC40 subunit of Pol III. Lack of an integrase/AC40 interaction does not significantly affect Tyl integration frequency, however, it dramatically alters target site choice, leading to a major redistribution of Tyl insertion in the genome, principally to regions of heterochromatin. Thus, AC40, through its interaction with Tyl integrase, is the predominant determinant of targeting Tyl integration upstream of genes transcribed by Pol III-transcribed genes.

Les éléments génétiques mobiles sont des composants majeurs des génomes eucaryotes. Le choix de leurs sites d'intégration a des conséquences sur la stabilité du génome et sur l'expression des gènes. Tyl est un rétrotransposon de levure phylogénétiquement proche des rétrovirus. Son ARN génomique est reverse-transcrit en un ADNc qui est ensuite intégré dans le génome de la levure. Tyl s'intègre en amont des gènes transcrits par l'ARN polymérase III mais le déterminant principal de cette sélectivité reste à découvrir. Ces travaux décrivent une interaction entre l'intégrase de Tyl et la sous-unité AC40 de l'ARN polymérase III. L'absence de cette interaction n'affecte pas significativement la fréquence d'intégration de Tyl mais altère fortement la sélectivité des sites d'intégration. Dans ces conditions, les intégrations de Tyl sont redistribuées dans le génome avec une préférence visible pour les régions d'hétérochromatine. AC40 est donc k déterminant majeur de la sélectivité d'intégration des éléments Tyl en amont des gènes transcrits par l'ARN polymérase III.