Caractérisation des a-L-arabinofuranosidases de la famille GH62 chez le champignon filamenteux Talaromyces versatilis (basionyme Penicillium funiculosum) et étude de leur impact, en association avec des xylanases, sur la dégradation d'arabinoxylane

par Marion De la Mare

Thèse de doctorat en Ingénierie Microbienne et Enzymatique

Sous la direction de Jean-Marie François.

Soutenue le 16-01-2014

à Toulouse, INSA , dans le cadre de École doctorale Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries (Toulouse) , en partenariat avec LIPM. Laboratoire des interactions protéine-métal (cea cadarache) (laboratoire) , Laboratoire d'ingénierie des systèmes biologiques et des procédés (Toulouse) (laboratoire) , Laboratoire d'Ingéniérie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP) - INSA Toulouse / LISBP (laboratoire) et de Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés [LISBP] (laboratoire) .

Le président du jury était Thierry Giardina.

Le jury était composé de Jean-Marie François, Eric Dubreucq, Marc Maestracci.

Les rapporteurs étaient Jean-Guy Berrin, Luc Saulnier.


  • Résumé

    La société Adisseo produit un cocktail d’enzymes hydrolytiques appelé Rovabio® Excel sécrété par un champignon filamenteux Talaromyces versatilis. Ce cocktail est utilisé comme additif alimentaire pour augmenter la digestibilité de complexes polysaccharidiques en nutrition animale et ainsi augmenter la valeur nutritionnelle des matières premières agricoles. Une récente étude protéomique de ce champignon (Guais et al., 2008) a révélé la présence d’un grand nombre d’arabinofuranosidases (ABFs) appartenant à différentes familles de glycosides hydrolases : 5 ABFs de la famille GH54, 3 ABFs de la famille GH62 et enfin une de la famille GH51. Un des objectifs de mes travaux de thèse a été le clonage, l’expression hétérologue (hôte lévurien Pichia pastoris) des 9 gènes codant pour ces 9 enzymes et la caractérisation complète de la famille GH62. La caractérisation des capacités d’hydrolyse des ABFs 54 et 62 a également été étudiée grâce à une technique d’empreintes d’hydrolyse enzymatique sur arabinoxylane de blé. Enfin, la dernière partie de mes travaux consistait à confectionner des mélanges d’enzymes hydrolytiques des différentes familles d’ABFs associés à des xylanases et de suivre l’efficacité de la dégradation de l’arabinoxylane insoluble grâce à l’utilisation d’un réacteur torique permettant l’acquisition d’images et l’analyse en ligne de la dégradation. Ces travaux sur le réacteur ont permis de mettre en évidence une synergie entre Abfs et Xylanases.

  • Titre traduit

    Characterization of three GH62 α-L-arabinofuranosidases from Talaromyces versatilis (basionym Penicillium funiculosum) and impact study with xylanases on arabinoxylan degradation


  • Résumé

    Adisseo produce and commercialize a hydrolytic enzymatic cocktail termed Rovabio and secreted by a filamentous fungus Talaromyces versatilis. This cocktail is used as feed additive for increased digestibility of complex polysaccharides in animal nutrition. A recent genomic study of this fungus revealed the presence of 5 arabinofuranosidases (Abfs) to family GH 54, 3 of GH 62 and 1 of GH51. The first aim of my thesis works was about cloning, heterologous overexpression (in pichia pastoris yeast) of this 9 genes encoding for this 9 enzymes and characterization of the family GH 62. Mode of action of ABFs 54 and 62s has been characterized by enzymatic fingerprinting analysis on wheat arabinoxylan. Then, last part was to design enzymatic cocktail with differents families of ABFs and Xylanases and test their impact on insoluble arabinoxylan hydrolysis with toric reactor. These works on reactor have bringing to light a synergy between ABFs and Xylanases



Le texte intégral de cette thèse sera accessible librement à partir du 16-01-2019

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Cette thèse a donné lieu à une publication en 2014 par INSA à Toulouse

Caractérisation des a-L-arabinofuranosidases de la famille GH62 chez le champignon filamenteux Talaromyces versatilis (basionyme Penicillium funiculosum) et étude de leur impact, en association avec des xylanases, sur la dégradation d'arabinoxylane


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Informations

  • Sous le titre : Caractérisation des a-L-arabinofuranosidases de la famille GH62 chez le champignon filamenteux Talaromyces versatilis (basionyme Penicillium funiculosum) et étude de leur impact, en association avec des xylanases, sur la dégradation d'arabinoxylane
  • Détails : 1 vol. (199 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 193-199
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