Etude du rôle des protéines de la famille PPR doublement adressées à la mitochondrie et au plaste dans l'édition de l'ARN chez Arabidopsis thaliana

par Mauricio Lopez Obando

Thèse de doctorat en Biologie moléculaire et cellulaire

Sous la direction de Claire Lurin et de Richard Berthomé.

Le président du jury était Bénédicte Sturbois.

Le jury était composé de Peter Rogowsky.

Les rapporteurs étaient Philippe Giegé, Olivier Vallon.


  • Résumé

    La mitochondrie et le plaste sont des organites essentiels au sein de la cellule végétale. Les processus du métabolisme de l’ARN tels que la transcription, les modifications post-transcriptionnelles d'épissage et d’édition et la traduction des organites sont très similaires. Parmi les acteurs de ces processus, les protéines PentatricoPeptide Repeat (PPR) ont un rôle prépondérant. Dans ce travail de recherche, j’ai évalué, dans un premier temps, la double localisation des protéines PPR vers la mitochondrie et le chloroplaste chez Arabidopsis thaliana. La synthèse de l’ensemble des données ont permis d’établir que sur les 473 membres de la famille PPR chez A. thaliana, 9% ont une potentielle double localisation dans les deux organites. Un partie de ce travail de thèse, analyse et discute les implications évolutives et fonctionnelles au sein de cette classe de localisation. Afin de comprendre l’activité des protéines PPR dans les deux organites, j’ai focalisé mes analyses fonctionnelles sur quatre protéines PPR (OTP90, OTP91, OTP100 et DYW2) potentiellement impliquées dans le phénomène d’édition. Dans ce travail de thèse, j’ai pu mettre en évidence que les protéines OTP90 et DYW2 agissent sur l’édition des transcrits des organites et particulièrement que la protéine DYW2 participe dans l’édition des transcrits chloroplastiques comme aussi sur des transcrits mitochondriaux. Ainsi, les résultats de mon travail de recherche s’ajoutent aux récentes données, obtenues de par le monde, montrant que les protéines PPR peuvent avoir de rôles complexes bien influençant à la fois divers transcrits et/ou processus dans le métabolisme de l’ARN des organites.

  • Titre traduit

    Role of PPR proteins dually targeted to mitochondria and chloroplast in the RNA edition process in Arabidopsis thaliana.


  • Résumé

    Mitochondrial and plastid are essential organelles within the plant cell. The process of RNA metabolism such as transcription, post-transcriptional modifications as splicing and editing and translation are very similar in these organelles. Among the actors of these processes, the PentatricoPeptide Repeat (PPR) proteins have an important role. In this research, firstly, I assessed the dual localisation of PPR proteins to mitochondria and chloroplasts organelles in Arabidopsis thaliana. The synthesis of all the data, those produced during my thesis, those available in the literature and those contained in the proteomic databases have revealed that between the 473 members of the PPR family in A. thaliana, 9 % are potentially dually localaized in both organelles. A part of this thesis analyzes and discusses the evolutionary and functional implications of this class of localisation in the PPR family. In order to understand the activity of PPR proteins in both organelles, I focused my work in the functional analysis on four PPR proteins (OTP90, OTP91, OTP100 and DYW2 ) potentially involved in the editing process. Although functional characterization of these four proteins has not been fully completed, in this thesis, I was able to demonstrate that the OTP90 and DYW2 proteins act on editing of organelles transcripts and particularly I found that the DYW2 protein participates in the editing of chloroplast and mitochondrial transcripts. Thus, the results of my research are in concordance to recent data obtained by the world, showing that PPR proteins have complex roles influencing several transcripts and/or processes in the RNA metabolism of organelles.


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  • Détails : 1 vol. (311 p.)
  • Annexes : Notes bibliogr.

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  • Cote : 572.6 LOP etu
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