Intégration des lames virtuelles dans le dossier patient électronique

par David Ameisen

Thèse de doctorat en Thérapeutiques biotechnologiques

Sous la direction de Philippe Bertheau et de Jean-Baptiste Yunès.

Soutenue en 2013

à Paris 7 .


  • Résumé

    Les avancées technologiques dans le domaine de l'informatique médicale ainsi que l'augmentation systématique du volume d'information produit engendrent des questions de changement d'échelle et d'interopérabilité des nouveaux matériels, en particulier en imagerie, avec les systèmes d'information de santé. Il en résulte actuellement un manque de diversité d'images numériques sur lesquelles baser un avis médical ou en demander un second, sur place ou à distance. Nous avons ainsi conçu, développé et mis en production une plateforme web de mise en commun d'images médicales en rendant interopérable les systèmes d'acquisition et de restitution d'images normalisés et non normalisés avec les serveurs hospitaliers hébergeant les données patient. Cette plateforme donne accès à plus de 50000 documents multimédia tels que des rapports contenant du texte et des images, des images usuelles ou encore des images composées de plusieurs milliards de pixels : les lames virtuelles. Au cours de la réalisation de ces travaux, nous avons entrepris de formaliser l'appréciation visuelle de la qualité d'une image numérique et d'une lame virtuelle en élaborant des algorithmes proches de l'appréciation visuelle et plus rapide que les existants pour détecter le degré de flou présent dans les images numériques. Nous avons ensuiti développé des outils d'estimation en temps quasi-réel du flou comme premier indicateur pour l'analyse générale de la qualité des lames virtuelles pour les usages cliniques, pédagogiques et en recherche. Deux demandes de brevets, dont une en PCT, ainsi qu'une publication résultent de ces travaux, avec en perspective de nombreuses applications en imagerie généraliste et médicale.

  • Titre traduit

    Integrating whole slide images in the medical health record


  • Résumé

    Advances in medical informatics as well as the systematic increase of volume of digital information that is produced leads to the questions of scalability and interoperability of new hardware, particularly in imaging, with health information Systems. This can explain the present lack of diversity of digital images on which to base - or ask for - a medical opinion, whether on-site or from a remote location. We therefore designed, developed and put into production a web platform for sharing medical images by making acquisition and visualization Systems of standardized and non-standardized image interoperable with health information Systems hosting the patients' medical information. This platform provides access to more than 50000 multimedia files such as reports containing both text and images, common medical images and images made of billions of pixels: the whole slide images. During the completion of this work, we undertook to formalize what the visual assessment of the quality of a digital image and a whole slide image meant. We so designed algorithms or methods close to the visual assessment and faster than those published for 40 years in this field of imaging to detect in particular the amount of blur present in digital images. We then designed and developed tools to assess in near real-time the amount of blur present in a whole slide image as a first indicator for a more general assessment of the quality of a whole slide image for clinical use, teaching and research. This research resulted in two patent applications, including one in PCT, and one publication with the perspective of numerous applications in digital medical imaging

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  • Détails : 1 vol. (154 p.)
  • Annexes : 70 réf.

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  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2013) 010

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  • Non disponible pour le PEB
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