Recherche Avancée

Thèse soutenue

Étude des transporteurs ABC chez le champignon pathogène des plantes Botrytis Cinerea au cours de l'infection et en réponse à certains fongicides

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Auteur / Autrice : Elise Loisel
Direction : François Villalba, Christophe Bruel
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Microbiologie
Date : Soutenance le 18/06/2013
Etablissement(s) : Lyon 1
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Microbiologie, adaptation et pathogénie (Lyon)
Jury : Président / Présidente : Gilles Gay
Examinateurs / Examinatrices : François Villalba, Christophe Bruel
Rapporteurs / Rapporteuses : Marc Boutry, Giovanna Chimini, Sabine Fillinger

Résumé

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Lors de l'interaction entre un champignon phytopathogène et une plante hôte, des molécules toxiques peuvent être générées par l'agresseur mais aussi par les réactions de défense de la plante. Par ailleurs, les champignons phytopathogènes sont exposés aux traitements chimiques utilisés au champ à des fins antifongiques. Mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la tolérance de ces microorganismes à ces molécules toxiques constitue ainsi un point important tant au point de vue des interactions plante-pathogène que de la tolérance aux produits fongicides. Les transporteurs à efflux sont décrits comme participant activement au phénomène de tolérance en exportant les molécules toxiques hors de la cellule. Chez l'agent de la pourriture grise B. cinerea, différentes approches génétiques et bio-informatiques ont conduit à l'existence de 53 transporteurs ABC, dont quatre seulement ont été caractérisés et dont le rôle dans le processus infectieux du champignon est limité. Au cours de ce travail de thèse, la mesure de la réponse transcriptionnelle de l'ensemble des gènes ABC a montré une forte mobilisation des transporteurs à efflux au cours du processus infectieux de B. cinerea, et suggère un rôle global de cette super-famille de gènes dans l'interaction. Jusqu'à aujourd'hui, les études de tolérance des champignons phytopathogènes aux fongicides rapportées dans la littérature ont été conduites in vitro. Ici, l'étude a été conduite in planta et a révélé cinq gènes codant pour des transporteurs ABC sur-exprimés en réponse au traitement fongicide. Leur implication dans la détoxication a été étudiée par une approche de mutagenèse dirigée. Cette méthode n'a cependant pas permis de conclure quant au rôle des transporteurs délétés dans la tolérance au fongicide et/ou dans la pathogénie. Enfin, des résultats contradictoires co-existent actuellement sur le lien qu'il pourrait exister entre les tolérances des champignons aux antifongiques et l'activation de la transcription des gènes codant pour les transporteurs ABC impliqués dans l'efflux de ces derniers. Dans ce travail, ce point a été exploré à l'échelle de tous les gènes ABC de B. cinerea. Leur comportement transcriptionnel a été étudié en réponse à deux fongicides de mode d'action différents, dans des conditions de culture in vitro, mais également à différents stades d'une infection. L'analyse des séquences promotrices des gènes co-régulés par ces deux produits in vitro a permis l'identification de deux motifs putatifs de régulation et suggère l'implication potentielle de plusieurs facteurs de transcription dans la réponse aux fongicides