Etude de la régulation post-transcriptionnelle de l'expression du système à deux composants PhoQ-PhoP par les ARN régulateurs chez Escherichia coli

par Audrey Coornaert

Thèse de doctorat en Microbiologie [procaryote et eucaryote]

Sous la direction de Mathias Springer.

Soutenue en 2012

à Paris 7 .

  • Titre traduit

    Study of Post-transcriptional Regulation of Expression of PhoQ-PhoP two-component System by small regulatory RNA in Escherichia coli


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  • Résumé

    Les bactéries ont développé diverses stratégies leur permettant de survivre aux brusques changements de leur environnement. Par exemple, les systèmes à deux composants (SDC) sont des régulateurs transcriptionnels majeurs: souvent, une kinase, stimulée dans des conditions spécifiques, active le régulateur transcriptionnel qui lui est associé, afin de permettre la régulation de l'expression de ses gènes cibles. PhoQ-PhoP est un SDC central, activé dans des conditions de faible concentration de magnésium, d'acidification du milieu ou encore par les peptides antimicrobiens. En réponse, il active l'expression de nombreux gènes. Les ARN régulateurs sont aussi un moyen rapide d'adaptation. Chez les bactéries, l'action d'un grand nombre d'entre eux dépend de la protéine chaperon à ARN Hfq. Leur mode d'action consiste à s'apparier directement à l'ARNm cible par complémentarité imparfaite de séquence. Il en résulte une régulation, positive ou négative, de la traduction et/ou de la stabilité de l'ARNm cible. Nous avons montré que MicA et GcvB, deux ARN régulateurs Hfq-dépendants, réprimaient directement l'expression dephoPQ en se fixant à la région de démarrage de la traduction dephoP, entrant ainsi en compétition avec la fixation du ribosome. Etonnamment, ils affectent différemment l'expression des gènes cibles de PhoP : alors que MicA, contrôlé par sigma E, réprime l'expression du régulon, GcvB a un effet plutôt activateur. Ce résultat troublant attend encore une explication, même s'il semble lié à un effet pléiotropique de GcvB dans la cellule. Nous avons mis en évidence un lien entre trois systèmes d'adaptation bactériens différents: les ARNreg, les SDC et les facteurs sigma.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (236 p.)
  • Annexes : 281 réf.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2012) 129
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