Nouvelles fonctions de la protéine Cdc48 : une ATPase, chez la levure Saccharomyces cerevisiae

par Mélanie Bonizec

Thèse de doctorat en Génomes, épigénomes, destin cellulaire

Sous la direction de Catherine Dargemont.

Soutenue en 2012

à Paris 7 .


  • Résumé

    L'ubiquitylation est une modification post-traductionnelle impliquée dans de nombreux processus cellulaires qui nécessite une régulation fine. La protéine Cdc48, qui appartient à la famille des ATPases AÂA (ATPase associated with various activities), participe à cette régulation. En effet, il s'agit d'une chaperonne dépendante de l'ubiquitine, essentielle à la viabilité cellulaire, qui est capable de réguler le devenir de protéines ubiquitylées, directement ou indirectement via des cofacteurs. Cdc48 est impliquée dans la régulation de nombreuses fonctions biologiques et contribue à l'homéostasie cellulaire en participant à la dégradation de protéines via le système ubiquitine/ protéasome et l'autophagie. Lors de ma thèse, je me suis intéressée à la caractérisation de nouvelles fonctions de la protéine Cdc48 chez la levure S. Cerevisiae. Dans un premier temps, j'ai participé à la description d'une nouvelle fonction de Cdc48 et son cofacteur Ufd3, deux nouveaux partenaires du complexe de déubiquitylation Ubp3-Bre5, dans la ribophagie, un processus d'autophagie sélective permettant la dégradation vacuolaire des ribosomes matures en condition de carence nutritionnelle. Dans un deuxième temps, je me suis intéressée au rôle de Cdc48 dans le noyau et plus précisément à la chromatine. Cette étude a mis en évidence que la protéine Cdc48 est recrutée sur les gènes activement transcrits, et qu'elle régule le processus d'ubiquitylation de l'histone H2B sur certains gènes. Nous avons donc caractérisé une nouvelle fonction de la protéine Cdc48 qui serait un régulateur important de Pubiquitylation de l'histone H2B, une marque d'histone dont la fonction est encore mal comprise.

  • Titre traduit

    Novel functions of the ATPase Cdc48 in the yeast Saccharomyces cerevisiae


  • Résumé

    The ubiquitylation is a post-translational modification involved in numerous cellular processes and needs to be tightly regulated. The protein Cdc48, which belongs to the AAA ATPase family (ATPase associated with various activities), contributes to this regulation. Indeed, it is a ubiquitin-1 selective chaperone, essential for cell viability, which is capable of regulating the fate of ubiquitylated proteins directly or indirectly via specific cofactors. Cdc48 is involved in the regulation of a large array of biological processes and contributes notably to cellular homeostasis by participating in protein degradation via the ubiquitin/proteasome System and the autophagic pathway. During my PhD, I focused on the characterization of new fonctions of the protein Cdc48 in I the yeast S. Cerevisiae. At first, I participated in the description of a new function of Cdc48 and its cofactor Ufd3, two new partners of the deubiquitylation complex Ubp3-Bre5, in the ribophagy, a selective autophagy process induced by nutrient starvation that allows the vacuolar degradation of mature ribosomes. In a second time, I became interested in the role of Cdc48 in the nucleus and more specifically at the chromatin. This study showed that the protein Cdc48 is recruited to actively transcribed genes and that it regulates the process of the ubiquitylation of the histone H2B on certain I genes. We therefore characterized a novel function of the protein Cdc48, which would be an important regulator of the ubiquitylation of H2B, a histone mark whose function is still poorly understood.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (145 f.)
  • Annexes : 381 réf.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2012) 123
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