Contrôle de l'activité de l'exoribonucléase 5'-3' Xrn1 par Dcs1 et conséquences physiologiques chez S. Cerevisiae

par Flore Sinturel

Thèse de doctorat en Génomes et protéines

Sous la direction de Ciarán Condon.

Soutenue en 2012

à Paris 7 .

  • Titre traduit

    ˜The œimportance of Dcs1 control of 5' - 3' exoribonuclease Xrn1 activity for S. Cerevisiae physiology


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  • Résumé

    Chez S. Cerevisiae, le facteur Dcsl clive la coiffe des ARN messagers issus de la voie de dégradation 3f-5f et facilite l'activité de l'exoribonucléase 5'-3' cytoplasmique Xrnl. Contrairement aux modèles établis, nous montrons que ce contrôle sur Xrnl est indépendant de l'activité catalytique de Dcsl. Nous observons que Dcs1 augmente l'affinité apparente de Xrnl pour TARN et forme un complexe transitoire avec Xrnl in vitro. La présence de Dcs1 est requise pour la croissance sur glycérol et nous nous sommes interrogés sur l'importance dans ce phénomène de l'activation de Xrnl par Dcsl. Nous démontrons qu'un mutant catalytique de Xrnl est incapable de croître sur ce milieu et que c'est son activité exoribonucléolytique 5'-3' cytoplasmique qui est essentielle pour la croissance sur glycérol. Nous avons analysé l'effet d'une inhibition de l'activité de Xrnl par l'analyse de gels de protéine 2D. Nous observons qu'un groupe de protéines diminue en quantité dans une souche mutée dcsldcs2. De manière remarquable, certaines de ces protéines, essentielles pour la respiration cellulaire, sont aussi retrouvées en quantité moindre dans un mutant xrnl. L'analyse d'un candidat, POR1 codant la porine mitochondriale, a permis de vérifier l'impact de la voie de dégradation 5'-3' sur l'expression de l'ARNm et de la protéine correspondante. Le maintien de l'activité de dégradation de Xrnl par les facteurs Des est ainsi essentiel pour la respiration et explique l'absence de croissance sur glycérol de ces mutants. Nous proposons donc que l'activité de Xrnl contrôle l'accumulation d'ARN inhibant l'expression de facteurs nécessaires à la réalisation des fonctions mitochondriales.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (239 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 475 réf.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2012) 018
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