Rôle du complexe protéique NPHP1/NPHP4/RPGRIP1L impliqué dans la néphronophtise et les ciliopathies associées, dans la morphogenèse épithéliale, la polarité cellulaire et la ciliogenèse

par Helori-Mael Gaudé

Thèse de doctorat en Biologie cellulaire

Sous la direction de Sophie Saunier.

Le président du jury était Tania Attié-Bitach.

Le jury était composé de Sophie Saunier, Tania Attié-Bitach, Laurent Kodjabachian, Bénédicte Durand, Philippe Bastin.

Les rapporteurs étaient Laurent Kodjabachian, Bénédicte Durand.


  • Résumé

    La néphronophtise (NPH) est une néphropathie tubulo-interstitielle chronique de transmission autosomique récessive. Elle représente la cause génétique la plus fréquente des insuffisances rénales terminales de l’enfant et du jeune adulte (5 à 10%). Elle se caractérise au niveau histologique par des anomalies des membranes basales tubulaires, une fibrose interstitielle massive et par l’apparition tardive de kystes à la jonction cortico-médullaire. Dans 40% des cas, la NPH est associée à des atteintes extra-rénales, notamment oculaires, cérébelleuses ou osseuses, définissant de nombreux syndromes (Senior Løken, Joubert, Jeune, etc). Sur la quinzaine de gènes responsables de la maladie, sept ont été identifiés au laboratoire : NPHP1, NPHP4, NPHP8/RPGRIP1L, NPHP11/MKS3, NPHP12/TTC21B, NPHP13/WDR19 et IFT140. Les protéines codées par ces gènes forment des complexes moléculaires principalement localisés au niveau des jonctions cellulaires et du cil primaire des cellules épithéliales rénales, classifiant la NPH et les syndromes associés dans le groupe des "ciliopathies". Mes travaux de thèse se sont intégrés au projet de recherche de l'équipe, centré sur l'étude des mécanismes pathophysiologiques à l'origine des lésions observées dans la NPH. Pour cela, nous avons développé des modèles de cellules tubulaires rénales (MDCK, IMCD et HEK293), et des modèles animaux (souris et poisson zèbre en collaboration avec l'équipe de Sylvie Schneider-Maunoury UMR7622). Je me suis particulièrement intéressé à l'analyse des phénotypes cellulaires et à la caractérisation des voies de signalisation perturbées dans les cellules épithéliales rénales invalidées pour les gènes NPHP1, NPHP4 et NPHP8/RPGRIP1L. Les protéines codées par ces gènes forment un complexe au niveau du cil primaire et des jonctions cellulaires. J'ai participé à définir le rôle crucial de ces protéines dans l’établissement des jonctions serrées par leur interaction avec les protéines de polarité, la morphogénèse épithéliale en culture 3D et la ciliogenèse. De plus, j'ai mis en évidence que l'absence de ces protéines entraîne des anomalies de migration et d'adhésion cellulaires s’accompagnant d’une activation anormale des protéines Rho GTPases (Cdc42, Rac1 et RhoA) et d’une réorganisation du cytosquelette d’actine. J'ai par ailleurs montré que le complexe NPHP4/inversine/RPGRIP1L régule finement l'expression et la localisation de Dishevelled, élément clé des voies Wnt canonique et Wnt/PCP, dans les cellules rénales. Ceci est en accord avec les défauts de polarité planaire observés dans le pronéphros du poisson zèbre et dans le rein de la souris, après invalidation des gènes Nphp4 ou Rpgrip1l. L'ensemble de ces résultats a permis de mieux comprendre le rôle moléculaire et cellulaire des néphrocystines et les mécanismes pathophysiologiques aboutissant aux altérations retrouvées chez les patients telles que la fibrose interstitielle rénale et la formation de kystes.

  • Titre traduit

    Role of the protein complex NPHP1/NPHP4/RPGRIP1L involved in Nephronophthisis and associated ciliopathies, in epithelial morphogenesis, cell polarity and ciliogenesis


  • Résumé

    Nephronophthisis, a hereditary nephropathy characterized by interstitial fibrosis and cyst formation, is caused by mutations in NPHP genes encoding the ciliary proteins called nephrocystins. We investigate the function of nephrocystin-1, -4 and -8, in vitro and in vivo in mammalian kidney cells and in zebrafish respectively. Depletion of either NPHP1 (N1-KD), NPHP4 (N4-KD) or RPGRIP1L (RPGRIP1L-KD) by shRNA-mediated knockdown in MDCK cells led to abnormal ciliogenesis, delay in tight junction formation and disorganized structures in 3D culture. Moreover NPHP4 modulates the Wnt pathways during morphogenesis of the zebrafish pronephros and in mammalian kidney cells in which NPHP4 interacts with inversin and dishevelled, regulating its stability and its subcellular localization. Rpgrip1l is required for dishevelled stabilization at the cilium base and is necessary for polarized positioning of motile cilia of the zebrafish floor plate and sensory hair cells of the mouse cochlea. In either N1-KD or N4-KD cells, we also showed an over activation of Cdc42 and RhoA, downstream targets of dishevelled. This was accompanied by actin cytoskeletal disorganization, enhanced spreading on collagen, over-activation of proteins that regulate focal adhesion structures i.e p130cas-Pyk2 and increased cell migration. Interestingly, the stable expression of dominant negative form of Cdc42 in knockdown cells rescued the migration and the 3D phenotypes. In parallel, we observed that loss of Nphp4 in mice caused cystic tubular dilatation after subtotal nephrectomy correlated with alteration of ciliogenesis and over activation of Cdc42 and RhoA. Our data show a role of nephrocystins in epithelial cell organization and kidney morphogenesis in particular in regulation of focal adhesion, tight junction, ciliogenesis via dishevelled stability.

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Cette thèse a donné lieu à une publication en 2013 par Université Paris Descartes à Paris

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Informations

  • Sous le titre : Rôle du complexe protéique NPHP1/NPHP4/RPGRIP1L impliqué dans la néphronophtise et les ciliopathies associées, dans la morphogenèse épithéliale, la polarité cellulaire et la ciliogenèse
  • Détails : 1 vol. (154 p.)
  • Notes : Thèse soutenue sur un ensemble de travaux. Nephrocystin-1 and nephrocystin-4 are required for epithelial morphogenesis and associate with PALS1/PATJ and Par6 / Delous, Marion, Hellman, Nathan E. , Gaude, Helori-Mael, Silbermann, Flora, Le Bivic, Andre, Salomon, Remi, Antignac, Corinne, Saunier, Sophie. - Human Molecular Genetics, 2009. . Control of the Wnt pathways by nephrocystin-4 is required for morphogenesis of the zebrafish pronephros / Burckle, Celine, Gaude, Helori-Mael, Vesque, Christine, Silbermann, Flora, Salomon, Remi, Jeanpierre, Cecile, Antignac, Corinne, Saunier, Sophie, Schneider-Maunoury, Sylvie. - Human Molecular Genetics, 2011. . Dishevelled stabilization by the ciliopathy protein Rpgrip1l is essential for planar cell polarity / Mahuzier, Alexia, Gaudé, Helori-Mael, Anselme, Isabelle, Silbermann, Flora, Leroux-Berger, Margot, Delacour, Delphine, Ezan, Jerome, Montcouquiol, Mireille, Saunier, Sophie, Schneider-Maunoury, Sylvie, Vesque, Christine, Grampa, Valentina. - The Journal of Cell Biology, 2012. . Nephrocystins depletion lead to migration and adherence defects of MDCK cells associated with up regulation of Rho GTPases and their effectors / Gaudé, Helori-Mae, Montjean, Rodrick, Delous, Marion, Silbermann, Flora, Grampa, Valentina, Antignac, Corinne, Saunier, Sophie. - ,.
  • Annexes : Bibliogr. p. 135-154
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