Epidémiologie de la Péripneumonie Contagieuse bovine(PPCB) dans les régions du Delta Central du Mali : évaluation des performances de deux tests de diagnostic pour analyser la dynamique de transmission et développement d'outils d'aide à la décision pour la surveillance et le contrôle.

par Cheick Abou Kounta Sidibe

Thèse de doctorat en Biologie Santé

Sous la direction de Emmanuel Camus et de François Roger.

Soutenue le 16-05-2012

à Montpellier 2 , dans le cadre de Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (Montpellier ; Ecole Doctorale ; ....-2014) , en partenariat avec CIRAD TA A-22/E Campus International de Baillarguet (laboratoire) .

Le président du jury était Jean-Pierre Hugot.

Le jury était composé de Emmanuel Camus, François Roger, Jean-Pierre Hugot, Dominique j. Bicout, Christian Ducrot.

Les rapporteurs étaient Dominique j. Bicout, Christian Ducrot.


  • Résumé

    Deux tests sérologiques (test de fixation de complément (CFT) et l'ELISA de compétition (cELISA)) sont recommandés par l'OIE et utilisés couramment au Laboratoire Central Vétérinaire de Bamako parfois en parallèle dans le diagnostic et le dépistage de la péripneumonie contagieuse bovine (PPCB). La performance de ces tests a été estimée différemment par plusieurs auteurs dans des contextes épidémiologiques différents à partir de méthodes statistiques standards avec un statut sanitaire réel des animaux partiellement ou totalement connu. Dans un milieu où la PPCB est endémique avec différents stades d'évolution de la maladie, sachant que les tests sérologiques sont non parfaits (non gold standards), l'utilisation d'une approche bayésienne semblait appropriée pour une appréciation précise des paramètres de performance de tests qui sont la sensibilité et la spécificité, afin de mieux apprécier la prévalence de la maladie dans le cheptel bovin du delta central du Niger au Mali. Les résultats d'analyse de laboratoire des échantillons de terrain ont servi de bases de données importantes pour une analyse descriptive de la situation épidémiologique par appréciation des patrons de variations des principaux paramètres pouvant exercer une influence majeure sur la propagation de la PPCB. Ceci, dans le but d'aider à la réflexion sur la recherche d'outils et stratégies nouvelles dans le processus de prévention et d'éradication de la PPCB par le développement des modalités d'implantation d'une méthodologie innovante, pratique et efficace comme la qualification sanitaire troupeau concernant la PPCB dans un environnement d'élevage extensif. Cette thèse a permis de mieux définir les corrélations entre les deux tests, d'observer une meilleure sensibilité de cELISA par rapport à CFT permettant de justifier son utilisation seule dans un programme de dépistage à large échelle de la PPCB dans un milieu endémique. La démonstration dans l'étude de l'existence d'agrégation des animaux séropositifs à l'échelle du troupeau et aussi géographique montre qu'un système de qualification sanitaire troupeau pourrait jouer en collaboration avec le réseau national de surveillance épidémiologique vétérinaire, un rôle prépondérant dans la lutte ciblée et la maîtrise de la propagation de la PPCB au Mali. Mots clefs : PPCB-cELISA-CFT-Approche bayésienne-Agrégation-qualification sanitaire-Bovin

  • Titre traduit

    Epidemiology of contagious bovine pleuropneumonia (CBPP) in Central Delta of Niger areas in Mali : Performance evaluation of two diagnostic tests to analyze the dynamics of transmission and development of tools for decision support for monitoring and control.


  • Résumé

    Two serological tests (complement fixation test (CFT) and competitive ELISA (cELISA)) are recommended by the OIE and commonly used in Central Veterinary Laboratory of Bamako sometimes in parallel, in the diagnosis and screening for contagious (CBPP). The performance of these tests has been estimated differently by several authors in different epidemiological settings using standard statistical methods with a real status of animals partially or completely known. In an environment where CBPP is endemic and where different stages of disease are available, given that serological tests are not perfect (not gold standard), the use of Bayesian approach seemed appropriate for an accurate assessment of the performance parameters of tests which are the sensitivity, specificity and predictive values to better assess the prevalence of the disease in cattle in the central Niger delta in Mali. The results of laboratory analysis of field samples were used as large database for epidemiological analysis of the geographical distribution of seroprevalence and the influence of major risk factors for the spread of CBPP. This, in order to aid reflection on tools research and new strategies in the process of prevention and eradication of CBPP by developing for implementation of an innovative, practical and effective methodology as sanitary qualification of cattle. This thesis has helped define the correlations between the two tests, observing a better sensitivity of cELISA compared to CFT to justify its use only in a program of widespread testing of CBPP in an endemic environment. In this study, the proof of the existence of aggregation of seropositive animals across herds and geographical level shows that a sanitary qualification system of cattle can play in collaboration with the national network of veterinary epidemiological surveillance a leadership role in targeted control and mastery of the spread of CBPP in Mali.Keys words: CBPP- cELISA - CFT- Bayesian approach -Aggregation- Sanitary qualification –Bovine


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