Modélisation de la mortalité bovine dans un objectif de surveillance épidémiologique

par Jean-Baptiste Perrin

Thèse de doctorat en Épidémiologie

Sous la direction de Didier Calavas et de Christian Ducrot.

Le président du jury était René Ecochard.

Le jury était composé de Gilles Salvat, Pascal Hendrikx.

Les rapporteurs étaient Loïc Josseran, Dominique Costagliola.


  • Résumé

    La surveillance syndromique est un concept récent en épidémiologie. Fondée sur le suivi automatisé d’indicateurs de santé non spécifiques, cette nouvelle approche offre des perspectives intéressantes pour la détection de phénomènes pathologiques émergents. Nous nous sommes basés sur les données actuellement collectées en France sur la mortalité bovine pour évaluer la faisabilité et la pertinence d’un système de surveillance syndromique basé sur cet indicateur. Nous avons d’abord modélisé le niveau de référence de la mortalité bovine en France puis proposé des méthodes pour identifier et quantifier d’éventuels excès de mortalité. Nous avons d’abord analysé des données réelles pour estimer rétrospectivement les conséquences sur la mortalité de l’épizootie de fièvre catarrhale ovine qui a touché le cheptel bovin français en 2007 et 2008. Nous avons ensuite proposé une méthode visant à identifier des regroupements d’unités spatiales présentant des augmentations inhabituelles de mortalité, et évalué ses performances pour détecter des foyers d’une maladie infectieuse dont nous avons simulé la propagation dans le cheptel bovin. Sur la base de ces travaux, nous discutons finalement de l’intérêt pour la protection de la santé animale d’un système de surveillance non spécifique basé sur la mortalité, et émettons des propositions pour la mise en place opérationnelle d’un tel système.

  • Titre traduit

    Modeling cattle mortality : use for syndromic surveillance


  • Résumé

    Syndromic surveillance is a recent concept in epidemiology. Based on automated monitoringof non-specific health indicators, this new approach offers interesting prospects for the detection of various health events. We analyzed data on cattle mortality routinely collected inFrance to assess the feasibility and relevance of a syndromic surveillance system based on this indicator. We modeled the baseline of cattle mortality in France and proposed methods to identify and quantify excess mortality. First we analyzed real data to retrospectively estimate the effects on mortality of the bluetongue outbreak which affected the French cattle in 2007 and 2008. We then proposed a method to detect unusual increases mortality, and evaluated its performance for the detection of outbreaks of an infectious disease of which we simulated the spread in the cattle population. We finally discuss the interest of a surveillance system based on non-specific mortality for the protection of animal health, and make proposals for the operational implementation of such a system.


Il est disponible au sein de la bibliothèque de l'établissement de soutenance.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Claude Bernard. Service commun de la documentation. Bibliothèque numérique.
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.