Thèse de doctorat en Traitement du signal et télécommunications
Sous la direction de Guy Carrault et de Alfredo Hernández Rodriguez.
Soutenue en 2011
à Rennes 1 en cotutelle avec l'Universidad Simón Bolívar (Caracas) , dans le cadre de École doctorale Mathématiques, télécommunications, informatique, signal, systèmes, électronique (Rennes) , en partenariat avec Université européenne de Bretagne (autre partenaire) .
Cette thèse a comme domaine applicatif la détection précoce des événements d'apnée-bradycardie (AB) chez le prématuré. Après avoir situé l'importance sur le plan clinique de la détection des AB, une démarche méthodologique est proposée. Elle s'appuie sur un processus de fouille de données qui inclut le nettoyage et l'extraction de caractéristiques. Au chapitre 3, une méthode originale à base d'algorithmes évolutionnaires, pour optimiser des seuils et fenêtres d'analyse, est proposée pour adapter les algorithmes de traitement du signal ECG aux caractéristiques spécifiques du prématuré, très différentes de l'EGC de l'adulte. Au chapitre 4, une approche semi-Markovienne est adaptée pour la modélisation des dynamiques et plusieurs améliorations sont proposées : hétérogénéité des modèles, adaptation au traitement en ligne, optimisation de la gamme dynamique, extension de l'observabilité. Au chapitre 5, ces propositions sont exploitées dans des expériences de classification et de détection en ligne, tant sur signaux simulés que réels. Les résultats mettent bien en exergue l'intérêt de prendre en compte la dynamique des signaux. Ils soulignent également qu'avec un prétraitement approprié tel que la quantification des observations, l'introduction du retard entre les observables, un gain notable en performance peut être observé.
Multivariate detection of apnea-bradycardia episodes in pretem infants by hidden semi-Markov models
This dissertation studies the early detection of apnea-bradycardia (AB) events in preterm infants. After defining the importance of AB detection from a clinical point of view, a methodological approach is proposed. It relies on a data mining process that includes data cleansing and feature extraction. In chapter 3, a novel method based on evolutionary algorithms, for optimizing the thresholds and the analysis windows, is proposed to adapt the algorithms of the ECG signal to the specific characteristics of preterm infants, very different from the EGC of adult. In chapter 4, a semi-Markovian approach is adapted for modeling of dynamics and several improvements are proposed : heterogeneous models, adaptation to online processing, optimization of experiments, are reported on simulated and read signals. They clearly highlight the importance of considering the dynamic of the signals. They also emphasize that with a suitable pre-treatment such as the quantification of observations and the introduction of delay between the observable, a significant gain in performance can be observed.