Aspects épidémiologiques et variabilité génétique moléculaire des virus FOAMY et HHV-8 dans des populations rurales du Sud Cameroun : des premières étapes de l'émergence virale à la persistance et transmission interhumaine

par Edouard Betsem a Betsem

Thèse de doctorat en Microbiologie et virologie

Sous la direction de Antoine Gessain.

Soutenue en 2011

à Paris 7 .


  • Résumé

    Ce travail, décrit les aspects épidémiologiques de l'émergence par transmission inter-espèce des virus foamy simiens dans des régions du Sud Cameroun, de même que les aspects d'épidémiologie sérologique et moléculaire de l'HHV-8. Les virus foamy appartiennent appartiennent au genre Spumavirus dans la famille Retroviridae et infectent naturellement de nombreuses espèces de primates non-humains. Des cas humains d'infection par transmission interespèces ont été démontrés dans des situations professionnelles en Amérique du Nord et en Europe, et en milieu naturel en Asie et en Afrique. La transmission secondaire et la pathogénicité de ces virus restent non démontrés. Autour de la réserve du Dja, les populations les populations sont fréquemment en contact avec différentes espèces de PNH. Un «groupe contact» de 198 individus âgés à 80% de 15 à 40 ans a été testé et la séroprévalence de l'infection y est de 26,7% (53/198). De l'ADN viral a été amplifié chez 20,7% des individus (41/198) avec une durée moyenne de persistance virale de 17 ans. Dans la population générale, la séroprévalence chez 1321 (5 - 90 ans) personnes testées est de 2% (26/1321) et de l'ADN viral est retrouvé dans 0,2% (2/1321) des cas. Les morsures et les grands singes sont fortement associés à l'infection mais d'autres modes de transmission peuvent être évoqués. Les charges (pro)virales sont faibles (>1 - 145 copies/10⁵ copies), la transmission secondaire n'a pas pu être mise en évidence parmi 30 épouses et 12 enfants apparentés à des cas index. L'analyse de 38 séquences de 425 pb de gorille (30), de chimpanzé (3) et de cercopithèque (5) a montré une faible variabilité entre ces dernières. Une étude cas-témoins recherchant la pathogénicité du virus foamy chez les cas index est en cours. L'HHV-8 est un gammaherpès virus du genre Rhadinovirus. Il est responsable de toutes les formes du sarcome de Kaposi dont la forme endémique est très fréquente au Cameroun. Peu de données existent sur l'HHV-8 au Cameroun. Une population de 2063 individus (787 Pygmées de 2 à 83 ans et 1276 Bantous de 2 à 85 ans) testée révèle une séroprévalence HHV-8 de 37,2% (768/2063) plus élevée chez les Pygmées (x² =50. 08, p<10⁻⁶ ) sans différence entre les sexes. Les 29 séquences obtenues appartiennent aux sous-types circulant en Afrique A5 et B. Des études complémentaires incluant des patients avec un SK sont en cours.

  • Titre traduit

    Epidemiological features and genetic variability of simian foamy viruses and KSHV in populations living in South Cameroon : from the early steps of a viral emergence in a human population to the persistence and interhuman dissemination


  • Résumé

    The present work describes epidemiological features of cross-species emergence of simian foamy viruses in remote human populations in South Cameroon, as well as serological and molecular epidemiology of human herpes virus 8. FV belong to the Spumavirus genera among the Retroviridae. Human cross-species infections from NHP have been demonstrated in occupational situations in North America and Europe, and in natural settings in Asia and Central Africa. Secondary transmission and pathogenicity in infected persons is still an open issue. Populations neighbouring the Dja nature reserve are frequently in contact with different species of NHP. We tested 198 individuals in a "contact group" (80 % aged 15 to 40 years), who reported a physical contact with a NHP, mostly during hunting (83% of these occurred during the last 20 years). SFV seroprevalence among these is 26. 7% (53/198). Viral DNA from the po/-ln and/or LTR were amplified in 20. 7% (41/198) of these individuals with an average persistence period of 17 years. In a group identified as "general population", we tested 1321 persons aged 5 to 90 years. SFV seroprevalence in this group is 2% (26/1321) and viral DNA was amplified in 0. 2% (2/1321). Factors associated to this infection are apes and bites, but other transmission modes can be considered. (Pro)viral loads are low (<1 to 145 copies / 10⁵ cells). Secondary transmission from an index case to a family member could not be demonstrated in 30 wives of 12 children despite a positive serology was found in a spouse. Analysis of 38 (425 bp) po/-ln sequences shows low variability. They belong to gorilla (30), chimpanzee (3) and Cercopithecus (5) species found in the areas, matching the hunters story. A case control study is underway in order to search for pathogenicity in infected individuals. HHV-8 belongs to the Gammaherpesvirinae subfamily and to the Rhadinovirus genera. This virus is responsible of all forms of Kaposi sarcoma, endemic in Cameroon. Data on the infection and the virus are very rare. A population of 1263 (787 Pygmies aged 2 to 83 years and 1276 Bantus aged 2 to 85 years) individuals was tested for HHV-8 and a high 37. 2% (768/2063) seroprevalence rate was found. Bantus are more infected than Pygmies (x² =50. 08, p<10⁻⁶ ) and no differences was observed according to sex. The 29 polymorphic 737 bp Kl (ORF_K1) sequences obtained belong to circulating A5 and B sequences found in Africa. Complementary analyses are underway including KS patients.

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  • Détails : 1 vol. (250 f.)
  • Annexes : 535 réf.

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  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2011) 155
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 8764
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