Réplication intestinale de bactériophages virulents infectant une souche Entéroagrégative de Escherichia coli

par Damien Maura

Thèse de doctorat en Microbiologie et virologie

Sous la direction de Laurent Debarbieux et de Chantal Le Bouguénec.

Soutenue en 2011

à Paris 7 .


  • Résumé

    Depuis plus de 20 ans, la prévalence croissante des bactéries antibiorésistantes nécessite la recherche de nouvelles voies thérapeutiques, telles l'utilisation des bactériophages. Leur efficacité thérapeutique a été démontrée pour traiter des infections chez l'animal, ainsi que pour cibler des souches pathogènes présentes dans l'intestin. Cependant, aucune description des interactions entre des bactériophages et leur bactérie cible in vivo au sein d'une communauté polymicrobienne telle que le microbiote intestinal n'a encore été entreprise. L'objectif de ce travail a été de déterminer si des bactériophages peuvent infecter spécifiquement une souche pathogène de Escherichia coli implantée dans l'intestin de souris, ainsi que de déterminer quels sont les facteurs influençant l'interaction entre ces bactériophages et leur hôte au sein de cet environnement. Nous avons isolé et caractérisé trois bactériophages spécifiques d'une souche entéroagrégative de E. Coli (55989). L'étude de leurs propriétés in vitro a permis de déterminer que certains de ces bactériophages sont capables d'infecter des biofilms et des agrégats cellulaires formés par la souche 55989. De plus, ces bactériophages ont permis la réduction transitoire de la concentration de 55989 dans l'intestin grêle de souris. Nous avons ensuite montré que la physiologie de la bactérie hôte au sein de l'intestin est déterminante pour le déroulement de cycles infectieux complets. L'ensemble de ces études apporte des connaissances nouvelles sur les paramètres qui gouvernent les relations entre bactériophages et bactéries dans l'intestin, et seront utiles lors de l'éventuelle application thérapeutique pourrait être développée.

  • Titre traduit

    Intestinal replication of virulent bacteriophages infecting an enteroaggregative escherichia coli strain


  • Résumé

    For over 20 years, the continual increase in the prevalence of infections caused by antibiotic resistant bacteria requires the search for new therapeutic approaches, such as the use of bacteriophages. Bacteriophages therapeutic effïcacy has been demonstrated to treat numerous animal infections and also to target pathogenic strains present in the intestine. However, to date, no description of the interactions between bacteriophages and their target bacterium has yet been undertaken in vivo within a polymicrobial community such as the gut microbiota. The objective of this study was to determine whether bacteriophages can infect a specific pathogenic strain of Escherichia coli located in the gut of mice, and to determine the factors that influence the interaction between bacteriophages and their hosts in this environment. First, we isolated and characterized three bacteriophages specific to an enteroaggregative E. Coli strain (55989). The study of their in vitro properties has determined that some of these bacteriophages can infect biofilms formed by strain 55989 as well as bacterial aggregates formed on the surface of epithelial cells. Moreover, these bacteriophages have allowed the transient reduction of the concentration of 55989 in the mouse small intestine. We then showed that the physiology of the host bacterium in the intestine is crucial for the conduct of complete viral infection cycles. Taken together, these results provide new insights into the parameters that govern the relationships between bacteriophages and bacteria in the gut, parameters that will be to consider in order to better apprehend conditions for a possible therapeutic application of bacteriophages.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. ([293] p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 330 réf.

Où se trouve cette thèse ?