Etudes biophysique et structurale d'ADN polymérases

par Jérôme Gouge

Thèse de doctorat en Biomolécules, biologie structurales, pathologies, biothérapies

Sous la direction de Marc Delarue.

Soutenue en 2011

à Paris 7 .

  • Titre traduit

    Biophysical and structural studies of DNA polymerases


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    La réplication du génome est réalisée par des ADN polymérases qui vont dupliquer l'information génétique en insérant un nucléotide dans le brin amorce de façon complémentaire au brin matrice. La sélection du nucléotide est réalisée lors de sa liaison dans le site catalytique. Le taux d'erreur des polymérases est d'environ 10⁻⁶ erreurs/base répliquée. Cette fidélité est assurée parce que les réplicases peuvent dégrader l'amorce en cas de mésappariement. Cependant, l'ADN est soumis à des agressions constantes de l'environnement si bien que Les réplicases doivent parfois faire face à des bases lésées ou des cassures double brin. Dans certains cas, elles peuvent insérer un nucléotide dans le brin amorce alors que l'instruction n'est pas canonique. Dans d'autres cas, elles s'arrêtent pour faire intervenir la machinerie de réparation, où d'autres ADN polymérases sont impliquées. Nous avons entrepris des études structurales d'une réplicase d'archée, P. Abyssi, pour comprendre son interaction avec un ADN canonique mais aussi avec des bases désaminées. A l'aide d'une dizaine de structures à résolution atomique, nous avons pu proposer un modèle rendant compte de l'arrêt de la polymérase lorsqu'elle reconnaît une base désaminée en amont du site catalytique. Un second volet porte sur des polymérases impliquées dans la réparation de l'ADN au travers de l'étude de polymérases X eucaryotes et bactériennes. Nous avons en effet résolu à 2,5 À la structure du complexe ternaire d'une polymérase X eucaryote. L'étude cristallographique des polymérases X bactériennes a conduit à enregistrer des données à 3,4 À. Les données SAXS suggèrent un arrangement des domaines inédits et très ouvert.

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La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (268 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 288 réf.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2011) 087
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