Search and Capture Model in different DNA Segregation processes

par Ludovic Brun

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de François Gallet et de François Nédélec.

Soutenue en 2011

à Paris 7 .

  • Titre traduit

    ˜Le œmodèle de recherche et capture dans différents processus de ségrégation de l'ADN


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  • Résumé

    La ségrégation des chromosomes chez les cellules eucaryotes et des plasmides chez les bactéries ont en commun une phase initiale de "recherche et capture" pendant laquelle des fibres explorent le volume de la cellule à partir d'une position spécifique. Schématiquement des polymères croissent à partir d'un point et essayent d'atteindre des cibles réparties dans un espace confiné. Etonnement, les fibres impliquées présentent un même type de dynamique. Nous présentons d'abord un modèle d'instabilité dynamique basée sur l'idée populaire que la croissance du polymère est permise par une coiffe à l'extrémité de la fibre. Le modèle inclut des interactions longitudinales entre les unités de monomère aux extrémités de chaque protofilament, et un 'sauvetage par effet cliquet'. Nous examinons ensuite le mécanisme de ségrégation des plasmides RI chez la bactérie. Des simulations basées sur les observations expérimentales existantes sont utilisées pour analyser les différentes étapes du processus et tester les différentes contributions et de la fasciculation des fibres. Nous montrons que le processus actif de ségrégation peut atteindre un niveau élevé de fidélité à un coût énergétique modéré pour la bactérie hôte. Enfin, nous étudions la phase de "recherche et capture" chez la levure bourgeonnante. Nous avons calculé la probabilité de capture d'un chromosome par microtubule et avons trouvé que des effets de confinement peuvent améliorer grandement. Des observations expérimentales réalisées supportent l'hypothèse selon laquelle les microtubules possèdent un certain degré de liberté de rotation à leur point d'ancrage avec le corps du pôle du fuseau.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (116 fp.)
  • Annexes : 151 réf.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2011) 026
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