Transcription regulators in crenarchaeal viruses : structure, targets and function

par Nuno Alexandre Lacerda Pereira Campos Peixeiro

Thèse de doctorat en Biologie moléculaire

Sous la direction de Guennadi Sezonov et de David Prangishvili.

Soutenue en 2011

à Paris 6 .

  • Titre traduit

    Régulateurs de la transcription chez les virus de crénarchées : structure, cibles et fonctions


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Chez les archées, les processus informationnels sont effectués par des protéines spécialisées qui ressemblent à celles des eucaryotes. La machinerie basale de transcription des Archaea a déjà été structurellement et fonctionnellement caractérisée en détail. Cependant, les facteurs de transcription archéens qui se lient à l'ADN et régulent spécifiquement la transcription des gènes ne sont pas bien compris. Au cours de ma thèse, deux régulateurs transcriptionnels viraux ont été caractérisés. L’un, AvtR, est codé par AFV6, un betalipothrixvirus infectant les membres du genre Acidianus. AvtR est un membre inhabituel de la superfamille RHH. Structurellement, AvtR est un monomère qui imite fonctionnellement l’homodimère classique RHH2. Les cibles de cette protéine sur le génome viral d’AFV6 ont été identifiées. Grâce à l’utilisation d'un système de transcription in vitro spécifique des crénarchées, il a été prouvé qu’AvtR agit comme un activateur ou un répresseur de différents gènes d’AFV6 d’une façon dépendant de la concentration. L'autre, SvtR, a été identifié chez le rudivirus SIRV1 infectant le crenarchaeon Sulfolobus islandicus. La structure de SvtR, montrant un motif RHH et formant des dimères en solution, a été résolue et ses cibles sur le génome de SIRV1 et sa fonction comme régulateur transcriptionnel ont été décrites. Pour ces deux régulateurs transcriptionnels, AvtR et SvtR, un modèle de régulation transcriptionnelle à distance par oligomérisation des régulateurs sur l’ADN est proposé. Ces résultats sont l'une des premières étapes vers l'élucidation des circuits complexes de régulation du cycle de vie des virus archéens

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Informations

  • Détails : 1 vol. (222 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 197-221. 235 réf. bibliogr.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
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  • Cote : T Paris 6 2011 174
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