Analyse transcriptomique des cancers de la vessie : application aux protéines Rab et partenaires

par Joël Rainui Ho

Thèse de doctorat en Sciences de la vie

Sous la direction de Bruno Goud et de François Radvanyi.

Soutenue en 2011

à Paris 6 .


  • Résumé

    Cette thèse présente deux études du cancer de vessie. La 1ère s’est intéressée à l’expression, au cours de la progression tumorale, de 61 protéines Rab et 223 partenaires. Un modèle à deux voies qui classe les tumeurs selon la présence (ou non) de mutation de FGFR3 a été utilisé. Le test SAM (Significance Analysis Microarray) a montré un total de 30 gènes sous-régulés et 13 gènes sur-régulés. LEPRE1, MICAL2, RAB23, STXBP1 et SYTL1 sont spécifiques des tumeurs T2-4 (FGFR3 wt). Un test binomial a montré que le cluster Rab27 (RAB27A/B et partenaires) était associé à ce cancer. Une 2ième étude s’est intéressée à l’expression des gènes de la puce Affymetrix HG U133 Plus. 2 au cours de la progression tumorale. Trois modèles ont été utilisés. Un modèle linéaire qui classe les tumeurs uniquement selon le stade, un modèle « FGFR3 » qui, en plus prend en compte la présence (ou non) de mutation de FGFR3, et un modèle « MRES » qui, en plus prend en compte la présence (ou non) du phénotype MRES (Multiple Regional Epigenetic Silencing). Une analyse comparative des résultats indique que les modèles à deux voies sont plus adaptés pour décrire cette pathologie et que les modèles à deux voies utilisés ici ne concordent pas

  • Titre traduit

    Transciptomic analysis of bladder cancers : application to Rab proteins and partners


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Informations

  • Détails : 1 vol. (169 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 154-169. 159 réf. bibliogr.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Consultable sur place dans l'établissement demandeur
  • Cote : T Paris 6 2011 24
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