Comportement des glycosidases en milieu liquide ionique : nouvelles approches de synthèse d'analogues de galactosycéramides

par Salim Ferdjani

Thèse de doctorat en Chimie, Chimie bioorganique

Sous la direction de Claude Rabiller et de Zeineddine Djeghaba.

Soutenue en 2011

à Nantes , dans le cadre de École doctorale Biologie-Santé Nantes-Angers , en partenariat avec Université de Nantes. Faculté des sciences et des techniques (autre partenaire) .


  • Résumé

    Cette thèse effectuée au sein de l’UMR U3B 6204 s’inscrit dans le cadre d’études portant sur l’activité des glycosidases catalysant la synthèse d’oligosaccharides. Une partie de ce travail s’intéresse à l’utilisation de ces enzymes en présence de liquides ioniques (LI), co-solvants susceptibles de favoriser la réaction de transglycosylation par diminution de l’activité de l’eau. La synthèse de galactosylcéramides (GalCer) choisie ici comme réaction cible pour cette étude en constitue le second volet. Les résultats notre étude menée sur trois glycosidases ont montré une forte diminution de leur activité avec l’augmentation de la concentration en LI. Ils indiquent aussi une forte corrélation entre leur thermostabilité, leur activité et leur stabilité dans les LI. Concernant la synthèse de GalCer et compte tenu de ce qui précède, nous avons essentiellement limité notre étude au milieu aqueux. Deux accepteurs précurseurs d’analogues de céramides ont été choisis. Le premier, le 2-amino-1-thiazolylpropan-1,3-diol s’est révélé mal reconnu par les glycosidases et seule une glycosynthase a permis de réaliser le couplage. Le second, un analogue cyclique a été conçu sur la base de modélisation. Cet accepteur peut-être synthétisé par aldolisation stéréosélective entre le DHAP et le 3-azido-2-(méthylsulfinothioyl)propanal catalysée par la Rham-1-P-aldolase. Nous avons réalisé la préparation de l’aldéhyde ainsi que celle du DHAP. Nous avons aussi produit la Rham-1-P-aldolase mais faute de temps, nous n’avons pu réaliser la réaction d’aldolisation.

  • Titre traduit

    Behavior of glycosidases in ionic liquid medium : new approaches to synthesis of analogues of galacosylceramide


  • Résumé

    This thesis, carried out at the UMR 6204 U3B, concerns studies on glycosidase activity for catalyzing the synthesis of oligosaccharide. A part of this work focuses on the use of these enzymes in presence of ionic liquids (IL), co-solvents which could promote transglycosylation reaction by decreasing the water activity. The synthesis of galactosylceramide (GalCer) chosen here as a target reaction for this study constitutes its second part. The results of our study carried out on three glycosidases have shown a strong decrease of their activity with increasing concentrations of IL. They also indicate a strong correlation between their thermostability, their activity and their stability in ILs. Regarding the synthesis of GalCer, we have essentially limited our study to the aqueous medium. Two acceptors, precursors of ceramide analogues, were chosen. The first, 2-amino-1-thiazolylpropan-1,3-diol, was found to be poorly recognized by glycosidases and only low yield coupling was achieved by a glycosynthase. The second, a cyclic analogue, was designed on the basis of modelling calculations. This acceptor could be synthesized by a stereoselective aldolisation between DHAP and 3-azido-2-(méthylsulfinothioyl) propanal catalyzed by Rham-1-P-aldolase. Toward this goal, we achieved the aldehyde and DHAP preparation andalso produced the Rham-1-P-aldolase but due to time constraints, we could not complete the aldolisation reaction.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (150 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 138-150.

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