Memory-aware algorithms : from multicores to large scale platforms

par Mathias Jacquelin

Thèse de doctorat en Informatique

Sous la direction de Yves Robert.

Le président du jury était Éric Sanlaville.

Le jury était composé de Yves Robert, Éric Sanlaville, Michel Dayde, Jean Roman, Oliver Sinnen, Loris Marchal.

Les rapporteurs étaient Michel Dayde, Jean Roman, Oliver Sinnen.

  • Titre traduit

    Algorithmes orientés mémoire : des processeurs multi-cœurs aux plates-formes à grande échelle


  • Résumé

    Cette thèse s’intéresse aux algorithmes adaptés aux architectures mémoire hiérarchiques, rencontrées notamment dans le contexte des processeurs multi-cœurs.Nous étudions d’abord le produit de matrices sur les processeurs multi-cœurs. Nous modélisons le processeur, bornons le volume de communication, présentons trois algorithmes réduisant ce volume de communication et validons leurs performances. Nous étudions ensuite la factorisation QR, dans le contexte des matrices ayant plus de lignes que de colonnes. Nous revisitons les algorithmes existants afin d’exploiter les processeurs multi-cœurs, analysons leurs chemins critiques, montrons que certains sont asymptotiquement optimaux, et analysons leurs performances.Nous étudions ensuite les applications pipelinées sur une plate-forme hétérogène, le QS 22. Nous modélisons celle-ci et appliquons les techniques d’ordonnancement en régime permanent. Nous introduisons un programme linéaire mixte permettant d’obtenir une solution optimale. Nous introduisons en outre un ensemble d’heuristiques.Puis, nous minimisons la mémoire nécessaire à une application modélisée par un arbre, sur une plate-forme à deux niveaux de mémoire. Nous présentons un algorithme optimal et montrons qu’il existe des arbres tels que les parcours postfixes sont arbitrairement mauvais. Nous étudions alors la minimisation du volume d’E/S à mémoire donnée, montrons que ce problème est NP-complet, et présentons des heuristiques. Enfin, nous comparons plusieurs politiques d’archivage pour BLUE WATERS. Nous introduisons deux politiques d’archivage améliorant les performances de la politique RAIT, modélisons la plate-forme de stockage et simulons son fonctionnement.


  • Résumé

    This thesis focus on memory-aware algorithms tailored for hierarchical memory architectures, found for instance within multicore processors. We first study the matrix product on multicore architectures. We model such a processor, and derive lower bounds on the communication volume. We introduce three ad hoc algorithms, and experimentally assess their performance.We then target a more complex operation: the QR factorization of tall matrices. We revisit existing algorithms to better exploit the parallelism of multicore processors. We thus study the critical paths of many algorithms, prove some of them to be asymptotically optimal, and assess their performance.In the next study, we focus on scheduling streaming applications onto a heterogeneous multicore platform, the QS 22. We introduce a model of the platform and use steady-state scheduling techniques so as to maximize the throughput. We present a mixed integer programming approach that computes an optimal solution, and propose simpler heuristics. We then focus on minimizing the amount of required memory for tree-shaped workflows, and target a classical two-level memory system. I/O represent transfers from a memory to the other. We propose a new exact algorithm, and show that there exist trees where postorder traversals are arbitrarily bad. We then study the problem of minimizing the I/O volume for a given memory, show that it is NP-hard, and provide a set of heuristics.Finally, we compare archival policies for BLUE WATERS. We introduce two archival policies and adapt the well known RAIT strategy. We provide a model of the tape storage platform, and use it to assess the performance of the three policies through simulation.


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