Thèse soutenue

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Auteur / Autrice : Isabelle Calvès
Direction : Jean Laroche
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie marine
Date : Soutenance en 2011
Etablissement(s) : Brest

Résumé

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Dans cette étude, nous avons exploré les réponses moléculaires, physiologiques et génétiques de populations de flet (Platichthys flesus), dans cinq estuaires présentant des conditions environnementales contrastées : au Portugal (le Mondego, système marquant la limite sud de l’aire de répartition du flet), en France (dans un système eutrophisé : la Vilaine, très pollué : la Seine et enfin dans un estuaire de référence : la Canche) et en Angleterre (la Tamar : estuaire pollué). Dans un premier temps nous avons analysé la structure génétique des populations en considérant des marqueurs de type microsatellites ; la diversité génétique est maintenue dans la population périphérique du Mondego qui présente par ailleurs une différenciation génétique marquée avec les autres populations. L’analyse du polymorphisme génétique sur l’AMP-desaminase, un gène candidat impliqué dans le métabolisme énergétique, suggère que les cocktails polluants peuvent exercer une pression de sélection directe ou indirecte sur ce gène, dans les estuaires présentant des contaminations chroniques (Seine & Tamar). Les réponses phénotypiques du flet ont été mesurées dans trois estuaires (Seine, Vilaine, Mondego). Les recherches menées au niveau moléculaire ont mis en évidence une baisse significative du niveau d’expression du gène CO II dans le Mondego, relativement aux autres estuaires. De manière plus générale, les réponses moléculaires suggèrent que le flet pourrait réduire la densité mitochondriale dans ses tissus et maximiser la production énergétique de sa mitochondrie. Des estimations de croissance moyenne journalière ont été menées par la lecture des otolithes ; elles suggèrent que le flet présenterait une augmentation de son taux de croissance du sud vers le nord de l’Europe. Des challenges hypoxiques ont été conduits au laboratoire sur les trois populations de flet ; ils suggèrent que la population du Mondego pourrait présenter une capacité de résilience réduite en situation de stress hypoxique. Nous formulons dans ce travail de nombreuses hypothèses sur le fonctionnement de populations de poissons, fortement impactées dans des « environnements estuariens extrêmes ».