Dynamique des bactéries nitrifiantes des procédés de traitement biologique du lisier de porcs et des eaux usées urbaines
Auteur / Autrice : | Alfredo Anceno |
Direction : | Patrick Dabert, Oleg Shipin |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Chimie |
Date : | Soutenance en 2010 |
Etablissement(s) : | Rennes 1 en cotutelle avec Asian institute of technology |
Partenaire(s) de recherche : | Autre partenaire : Université européenne de Bretagne (2007-2016) |
Mots clés
Résumé
Les travaux présentés concernent la caractérisation des communautés microbiennes nitrifiantes et dénitrifiantes d'un procédé de traitement du lisier de porcs selon plusieurs configurations de fonctionnement. Tout d'abord, les biais liés à l'utilisation des outils de typage moléculaire des ADNr16S par PCR-SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) ont été investigués sur des matrices environnementales telles que le compost, le lisier de porcs et le sol. Ensuite, les bactéries ammonium-oxydantes, nitrite-oxydantes et dénitrifiantes du procédé ont été analysées par PCR-SSCP des ADNr16S, réalisation d'inventaires du gène nosZ, et/ou quantification des gènes de nitrification (amoA, nxrB) et dénitrification (napA, narG, nirS, nirK, norB, nosZ) par qPCR. Ces outils ont permis de suivre le démarrage puis le fonctionnement du procédé selon trois configurations de fonctionnement : (i) réacteur seul, (ii) réacteur couplé en sortie d'un digesteur anaérobie et dérivation d'une partie de l'influent lors de la phase anoxique de dénitrification, et (iii) même configuration que ci-avant avec une recirculation des boues. L'analyse du fonctionnement des réacteurs, couplée à la mesure de l'activité de nitrification de la biomasse par respirométrie et à la caractérisation et quantification des groupes microbiens impliqués dans la conversion de l'azote, montre la mise en place du processus de nitritation-dénitritation dans la configuration (iii) du procédé qui s'accompagne de la dominance des bactéries ammonium-oxydantes, de la diminution des nitrite-oxydantes, et d'une fluctuation des bactéries dénitrifiantes hétérotrophes.