Compréhension des déterminants moléculaires de l'activation de la réplication du virus de l'hépatite C par corrélation d'informations biochimiques et structurales sur sa polymérase NS5B

par Déborah Harrus

Thèse de doctorat en Ingéniérie des protéines

Sous la direction de Stéphane Bressanelli.

  • Titre traduit

    Molecular determinants of the activation of the replication of hepatitis C virus, by correlating structural and biochemical information on its polymerase, the NS5B protein


  • Résumé

    Le virus de l'hépatite C (VHC) est un virus variable classifié en génotypes, qui diffèrent par leur distribution géographique, la sévérité des dommages causés au foie, et leur réponse aux traitements. L'ARN polymérase dépendante de l'ARN NS5B est une cible de choix pour les inhibiteurs du VHC. Les structures cristallographiques décrivent son organisation en 3 domaines appelés "doigts", "paume" et "pouce", le site catalytique se situant à la jonction entre ces trois domaines. Un segment C-Terminal de 40 acides aminés appelé "connecteur" part du pouce et relie les 530 résidus N-terminaux à une ancre transmembranaire de 21 résidus. La position du connecteur, replié au sein de la crevasse catalytique, est critique pour l'initiation de la synthèse d'ARN mais inhibitrice pour le processus d'élongation puisqu'il bloque l'enzyme en forme "pouce fermé". L'objectif de ce travail a été de réunir des informations biochimiques et structurales sur NS5B afin de mieux comprendre les mécanismes de la synthèse d'ARN de novo par le VHC, et plus spécifiquement les changements de conformation qui ont lieu lors de la transition entre les étapes d'initiation de d'élongation. Nous proposons un schéma explicatif de la séquence d'événements qui permettent la synthèse d'ARN. Celle-ci débute par la reconnaissance et la fixation de NS5B sur le génome viral, suivi par la fixation des deux premiers nucléotides incorporés, puis un repositionnement du dinucléotide néo-synthétisé grâce à des changements de conformation de NS5B pour permettre la poursuite de la synthèse d'ARN. La description de ce mécanisme constitue une avancée importante dans la compréhension du fonctionnement de VHC-NS5B.


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Hepatitis C virus (HCV) is a highly varaible virus, classified in genotypes that differ in their geographical distribution, the seriousness of the liver disease they cause, and response et the available treatment. RNA-dependant RNA polymerase NS5B is a choice target for specific inhibitors of HCV. Its organization can be described as a catalytic domain comprising the 530 N-terminal residues connected by a 40-residue linker to a C-terminal 21-residue transmembrane anchor. The linker occludes the catalytic cleft in the crystal structures of NS5B, a conformation likely conducive to initiation of RNA synthesis but clearly inhibitory to elongation, both because of direct steric hindrance and because it locks NS5B in a closed conformation. The main objective of our research was the understanding of the molecular mechanisms of de novo RNA synthesis by HCV, and more specially the conformation changes that occurs during the transition between the initiation and the elongation steps. We proposed a diagram explaining the sequence of events alllowing RNA synthesis. It begins with NS5B's recognition of the viral genome, followed by the fixation of the first two incorporated nucleotides, and so this neo-synthesized dinucleotide repositioning thanks to NS5B's conformational changes to allow the further RNA elongation. This mechanism description highly improves our understanding of HCV-NS5B.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (188 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 167-188

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Châtenay-Malabry, Hauts-de-Seine). Service Commun de la Documentation. Section Pharmacie.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 10PA114861 B
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