Variation et évolution génétique des virus de la dengue chez l'homme : cas des genotypes DENV-2 et DENV-4 circulants aux Antilles-Guyane

par Philippe Dussart

Thèse de doctorat en Microbiologie

Sous la direction de Jean-Charles Gantier.


  • Résumé

    En se basant sur l’épidémiologie de la dengue aux Antilles et en Guyane, nous avons étudié les génotypes DENV-2 et DENV-4 circulant dans la région. Les études phylogénétiques montrent une introduction récurrente de génotypes de DENV-2 et de DENV-4 de la zone Caraïbe vers le plateau des Guyanes. La caractérisation de 23 génomes de DENV-2 échantillonnés entre 1993 et 2006 en Guyane, au Suriname et aux Antilles confirme que ces virus appartiennent au génotype DENV-2 Asie-Amérique. Bien que la réintroduction récurrente de ce génotype soit observée en Guyane tout comme à Porto Rico, l'absence de sélection positive associée à la co-circulation des différents clades viraux dans le plateau des Guyanes s’apparente plus au profil de microévolution virale décrit en Asie du Sud-Est qu’à celui observé à Porto Rico. Ces résultats suggère l’intérêt d’un suivi génomique longitudinal de DENV à l’échelle Antilles-Guyane, voire d’une zone englobant la Caraïbe et le nord de l’Amérique du Sud.

  • Titre traduit

    Variation and genetic evolution of Dengue viruses in humans: a study of DENV-2 and DENV-4 genotypes circulating in the French West Indies and French Guiana


  • Résumé

    Based on the epidemiology of Dengue in the French West Indies and French Guiana, we studied the phylogeny and the microevolution of DENV-2 and DENV-4 circulating genotypes in the region. Phylogenetic studies showed a recurrent introduction of DENV-2 and DENV-4 genotypes from the Caribbean to the Guiana shield. The characterisation of 23 genomes of DENV-2 sampled between 1993 and 2006 in French Guiana, in Suriname and in the French West Indies confirms that these viruses belong to the DENV-2 Asian-American genotype. Although the recurrent reintroduction of this genotype is observed in French Guiana and Puerto Rico, the absence of positive selection associated with the co-circulation of different clades in the Guiana Shield relates more to the viral microevolution profile described in South-East Asia than the profile observed in Puerto Rico. These results suggest the interest of a longitudinal genomic surveillance of DENV in a zone including the Caribbean and the north of South America.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (192 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p.173-175

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Châtenay-Malabry, Hauts-de-Seine). Service Commun de la Documentation. Section Pharmacie.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 10PA114802 B
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