Etudes structurale et dynamique de la petite protéine G ARF1 par RMNAnalyse de l'échange nucléotidique et des interactions avec le myristate et ARFGAP1

par Vanessa Buosi

Thèse de doctorat en Sciences biologiques. Ingénierie des protéines


  • Résumé

    Arf1 est une petite protéine G qui joue un rôle d’interrupteur moléculaire, régulateur de la transduction du signal. Elle exige sous deux états structuralement très différents : lié au GPD (état inactif) ou au GTP (état actif) où Arf1 est liée à la membrane grâce à son hélice myristoylée. L’activation de Arf1 par son facteur d’échange suit une cascade d’évènements qui a été décrite par plusieurs structures cristallographiques. Cette activation entraîne un changement de conformation de la protéine, en présence de GTP, associé à un décalage de registre de deux résidus au niveau des feuillets β de l’interswitch. A l’heure actuelle, aucune donnée ne permet d’expliquer ce réarrangement. La première partie de ce travail a consisté à caractériser d’un point de vue structural et dynamique les formes GDP et GTP de Arf1 par RMN en solution. Dans un second temps, nous avons étudié l’interaction de Arf1 avec le myristate. Le dernier aspect a consisté en l’étude du complexe Arf1-ArfGAP1.

  • Titre traduit

    Structural and dynamic studies of the small GTPase ARF1 by NMR : analysis of nucleotide exchange and studies of ARF1-mytistate and ARF1-ARFGAP1 interaction


  • Résumé

    Arf1 is a small G protein that plays a molecular switch role, regulator of signal transduction. It exists in two different structural states : bound to GDP (the inactive state) or to GTP (the active state) where Arf1 is bound to the membrane through its myristoylated helix. Activation of Arf1, by its exchange factor, follows an ordered sequence of structural events, which have been pictured by crystallographic snapshots. This activation leads to conformational changes of the protein, in presence of GTP, associated with a two register shift of the interswitch β- strands. However, how Arf1 rearranges its central β sheet, is not explained by available data. The first part of this work consisted on the structural and dynamical characterizations of GDP and GTP forms of Arf1, by liquid state NMR. Secondly, we investigated the interaction of Arf1 with a myristate. Finally, we analyzed the Arf1-ArfGAP1 complex.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (VIII-254 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. VII-217-VII-227

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(2010)44
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