Influence de l'encombrement cytoplasmique sur la stabilité et la diffusion des protéines

par Clémence Le Cœur

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de José Teixeira.

Soutenue en 2010

à Paris 6 .


  • Résumé

    La cellule est un environnement complexe. Le pH, la force ionique ou l'encombrement cytoplasmique. . . Sont influencent les réactions biochimiques. Il est généralement difficile d'étudier in-vivo l'influence d'un seul de ces paramètres. Le volume exclu induit par la présence de nombreuses macromolécules en solution créé des interactions non spécifiques stériques. Nous avons étudié celle de l'encombrement sur deux aspects différents : la dynamique des protéines et l’équilibre état natif /état dénaturé. Des études ont permis de mettre en évidence que l'encombrement stabilisait la protéine à l'état natif en déstabilisant l'ensemble des états dénaturés. Les protéines dénaturées adoptent une conformation de chaîne gaussienne. Des mesures de diffusion de neutrons aux petits angles ont montré que le rayon de giration d'une chaîne gaussienne modèle diminuait considérablement avec la fraction massique en agent d'encombrement. Dans le cas de la myoglobine, celle-ci est stabilisée. En présence d'encombrement, le rayon de giration de la protéine dénaturée diminue. L'encombrement cytoplasmique modifie la dynamique des protéines. Il existe différents régimes de diffusion collective ou individuelle (à temps court et long). Le temps de relaxation mesuré pour les solutions d'hémoglobine fortement concentrées ne peut-être associé à un mouvement purement diffusif et peut être lié à un mouvement localisé. Nous avons étudié la structure d'un substitut sanguin, l'hémoglobine greffée de deux poly(ethylene glycol). La réactivité du complexe varie avec le poids moléculaire des polymères. L'étude de sa structure a permis d'observer que celle-ci était sans doute fortement reliée à sa réactivité.

  • Titre traduit

    Influence of macromolecular crowding on protein stability and dynamics


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Informations

  • Détails : 1 vol. (207 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 199-207. 125 réf. bibliogr.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
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  • Cote : T Paris 6 2010 65
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