Modélisation des réarrangements Valpha-Jalpha du TRA/TRD chez la souris et chez l'homme

par Florence Thuderoz

Thèse de doctorat en Ingénierie de la santé, la cognition et l'environnement

Sous la direction de Jacques Demongeot.


  • Résumé

    La recombinaison V(D)J constitue une recombinaison somatique et site-spécifique de l'ADN à l'origine de la diversité des récepteurs antigéniques des lymphocytes T chez les vertébrés mandibulés. Concernant la chaîne a des récepteurs T, les gènes V et J sont utilisés depuis l'intérieur du locus TRA vers les gènes distauxdurant des réarrangements successifs et ce sans exclusion allélique. La quantification expérimentale de certaines associations V -J chez la souris a permis de définir les tendances des répertoires combinatoires thymiques et périphériques. Un modèle numérique stochastique, basé sur des fenêtrages d'ouverture successives progressant sur les régions V et J durant les cycles de réarrangements, a permis une meilleure compréhension des règles dynamiques gouvernant les réarrangements V -J et a apporté la connaissance d'un répertoire combinatoire simulé renseignant les fréquences de toutes les associations V-Jo Lors de la transition à l'homme, la quantification des associations V -J a été réalisée au niveau du thymus, constituant un premier échantillonnage à large échelle du répertoire combinatoire TRA humain. L'étape de modélisation a offert une compréhension claire de la construction dynamique du répertoire a humain et a permis de proposer des prédictions sur la diversité du répertoire combinatoire. Finalement, la progression de l'accessibilité des gènes aux réarrangements selon des vitesses d'ouverture non-constantes associée à une ouverture synchronisée des régions J entre les deux allèles se sont révélées suffisantes pour expliquer les fréquences V -J expérimentales présentement disponibles pour les deux espèces ainsi que l'utilisation interallélique des gènes J.

  • Titre traduit

    Modeling of TRA/TRD locus Valpha-Jalpha rearrangements in Mice and Human


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Informations

  • Détails : 1 vol. (237 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 867 réf.

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  • Bibliothèque : Service interétablissements de Documentation (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque universitaire de Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS10/GRE1/0185/D
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