Molecular analysis of the sex-determining region of the platyfish Xiphophorus maculatus

par Astrid Böhne

Thèse de doctorat en Sciences de la vie

Sous la direction de Jean-Nicolas Volff.

  • Titre traduit

    Analyse moléculaire de la région du déterminisme du sexe chez le platy Xiphophorus maculatus


  • Résumé

    This work aimed to identify the sex-determining gene of the platyfish Xiphophorus maculatus. I characterized the gene Zisupton present on the Y but absent from the X chromosome. Zisupton encodes a new protein type, with domains involved in nucleic acid binding and protein-protein interaction. A testis-specific isoform carries further domains involved in ubiquitin/SUMO posttranslational protein modification. Further analysis revealed five other Zisupton copies in the platyfish genome. Analyses of these copies led to the identification of conserved boundaries delimited by inverted repeats. Different target site duplications and flanking sequences were found around each copy. These sequences are characteristics of transposons. Zisupton presents a new order of DNA transposons without sequence similarities to known transposons. Zisupton was recently active in the genus Xiphophorus and possibly subject to horizontal transfer. Zisupton might correspond to a mobile sex-determining gene.


  • Résumé

    Le but de ce travail était d'identifier le gène maître du déterminisme du sexe chez le platy Xiphophorus maculatus. J'ai caractérisé le gène Zisupton présent sur le chromosome Y mais absent du X. Zisupton code pour une nouvelle protéine impliquée dans les interactions avec des acides nucléiques et des protéines. Un isoforme spécifique des testicules porte des domaines supplémentaires impliqués dans la modification post-traductionnelles via les voies ubiquitin/SUMO. Le génome du platy contient cinq autres copies de Zisupton. Les copies sont délimitées par les mêmes séquences répétées et inversées. Différentes duplications du site d'insertion et régions flanquantes entourent chaque copie. Ces séquences sont caractéristiques des transposons. Nous proposons que Zisupton est membre d'une nouvelle classe de transposons. Zisupton a transposé récemment dans le genre Xiphophorus et a pu subir des transferts horizontaux. Zisupton pourrait être un gène mobile de déterminisme du sexe.

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Informations

  • Détails : 1 vol. ([243] p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 184-210

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