Étude de la diversité des peuplements épibiontes associés au tractus digestif de la crevette hydrothermale Rimicaris exoculata : une possible association mutualiste

par Lucile Durand

Thèse de doctorat en Écologie microbienne

Sous la direction de Marie-Anne Cambon-Bonavita.

Soutenue en 2010

à Brest .


  • Résumé

    Dans les écosystèmes hydrothermaux profonds, la chimiosynthèse microbienne est à la base des réseaux trophiques. Les symbioses entre des invertébrés et des micro-organismes sont fréquentes et peuvent être de différente nature et jouer différents rôles. La crevette Rimicaris exoculata est une espèce endémique des sites hydrothermaux de la Ride medio-Atlantique (MAR) et représente l’espèce majoritaire de la macrofaune de certains d’entre eux. Elle présente deux zones de colonisation microbienne, au niveau du céphalothorax et du tube digestif, mais leur rôle n’est pas encore établi. Ce travail a mis en évidence par approche moléculaire la présence de différentes communautés microbiennes dont une partie serait résidente, spécifique à R. Exoculata et représentée par des Deferribacteres, des Mollicutes et des Epsilonproteobacteria. Les approches microscopiques montrent la dominance d’épibiontes filamenteux étroitement associés à l’épithélium intestinal dont la croissance et l’installation semblent être contrôlées par l’hôte. Les approches moléculaires ont montré que: (1) les épibiontes du site hydrothermal Rainbow présentent une originalité taxinomique supposant une histoire évolutive ancienne tandis que les sites hydrothermaux Logatche et Ashadzé semblent avoir été colonisés plus récemment, (2) les épibiontes, non retrouvés dans le milieux extérieur et monophylétiques le long de la MAR pourraient être transmis verticalement et (3) il s’agirait d’une association mutualiste à caractère obligatoire. Ce travail de recherche a donc permis de poser les bases dans la compréhension du modèle symbiotique digestif R. Exoculata.

  • Titre traduit

    Study of the gut epibiont diversity of the hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata : a possible mutualistic association


  • Résumé

    In the deep-sea hydrothermal vents ecosystems, the driving energy comes from the microbial chemosynthesis. Symbioses between invertebrates and micro-organisms are common. They could be associations such as parasitism, commensalism or mutualism or even obligate symbioses and they could play distinct roles. The caridean shrimp Rimicaris exoculata is an endemic species of the Mid-Atlantic Ridge (MAR) hydrothermal sites. It is the main specie of the megafauna of some MAR sites. This crustacean harbors two microbial colonization regions, in the gill chamber and in the gut, but their roles are still unknown. Using various approaches, this work showed that there were distinct microbial communities among which a part would be resident and specific to R. Exoculata. This community is composed of Deferribacteres, Mollicutes and Epsilonproteobacteria. The microscopic approaches revealed the dominance of a single filamentous morphotype closely associated with the gut epithelium. Its settlement and growth seemed to be managed by the host. The molecular approaches showed that: (1) the Rainbow site epibionts harbored a phylogenetic particularity suggesting an ancient evolutionnary history whereas the Logatchev and Ashadzé seemed to have been colonized more recently by the association host-epibionts, (2) the epibionts, not retrieved in the surrounding environment and clustering i a monophyletic group along the MAR, could be vertically-transmitted, and (3) the association between R. Exoculata and the epibionts could be mutualistic and obligate. So, this research study gave the bases to understand the R. Exoculata symbiotic model.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (282 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 271-282

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  • Cote : TBRE2010/5
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  • Cote : F310-DUR-E
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