Conception d'un système protéique pour le ciblage de vecteurs non viraux au niveau des gènes codant les ARN ribosomiques

par Elodie Carnus

Thèse de doctorat en Sciences de la vie

Sous la direction de Yves Bigot.

Soutenue le 05-11-2009

à Tours , dans le cadre de Ecole doctorale Santé, sciences, technologies (Tours) , en partenariat avec SST/FRE CNRS 2969 - Laboratoire d'Etude des parasites Génétiques (équipe de recherche) .

Le président du jury était Denis Rasschaert.

Le jury était composé de Chantal Vaury, Chamsy Sarkis.

Les rapporteurs étaient Daniel Locker, Jacques Mallet.


  • Résumé

    Le principal défi des techniques de transfert de gènes est de garantir l’expression du gène d’intérêt tout en assurant l’innocuité des cellules génétiquement modifiées. La plupart des systèmes d’intégration, dérivés des transposons, assurent une intégration aléatoire au sein du génome de la cellule. L’enjeu de ce travail est de développer des outils permettant de cibler l’intégration du transgène au niveau d’un locus choisi dans le but d’améliorer la biosécurité. L’étude s’est portée sur l’utilisation des protéines à ZFD (Zinc Finger Domain) pour leur aptitude à être conçues à façon, in silico, en utilisant les nombreuses ressources disponibles sur Internet. Pour comparer, les propriétés de deux domaines de liaison, NterR2P, provenant de deux rétrotransposons R2 de type non-LTR, ont été étudiées pour leur capacité naturelle à reconnaître spécifiquement une région de 100 pb située dans l’ADN ribosomique 28S. Les résultats obtenus ont montré que les domaines NterR2P reconnaissent spécifiquement leur ADN cible avec une forte affinité de liaison. Deux protéines de fusion, utilisant le domaine NterR2P, ont ensuite été synthétisées dans le but d’intégrer le transgène au niveau de l’ADNr en utilisant le transposon Sleeping Beauty. L’idée originale de ce travail est de réaliser l’intégration du transgène via le ciblage indirect du transposon, ou de la transposase sans que celle-ci ne soit modifiée. L’impact de ces systèmes de ciblage sur les cellules nécessite de réexaminer une telle stratégie.

  • Titre traduit

    Design of protein systems to target non-vial vectors within genes encoding ribosomal RNA


  • Résumé

    The main challenge of gene transfer technologies is to maintain and to sustain transgene expression and to confer innocuity on the genetically-modified cells. Most integration systems, derived from transposons, integrate randomly within the genome of cells. The issue of this work is to develop tools to target transgene integrations in a selected locus in order to improve biosecurity. This study consists in using ZFD (Zinc Finger Domain) proteins for their capability to be in silico synthesize, in using many bioinformatic sites. For compare, the properties of two DNA binding domains (DBD), NterR2P, originating from the endonucleases encoded by R2 non-LTR retrotransposons, are able to bind specifically within a 100-bp region of the 28S rRNA genes. The results show that NterR2P DBDs specifically recognize their DNA target with high affinity. Two fusion proteins, using NterR2P DBD, are synthesized in order to integrate the transgene within rDNA, using Sleeping Beauty transposon. The original idea of this work is to realize transgene integration via indirect targeting of transposon, or transposase without its modification. The use of such a targeting system will have to be extensively studied to determine its impacts on cells before it can be considered as safe for use.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université François Rabelais. Service commun de la documentation. Bibliothèque de ressources en ligne.
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.