Analyse d'interactions moléculaires par RMN : Étude de la DHFR en présence d'osmolytes et structures de pseudopeptides antimicrobiens en environnement

par Baptiste Legrand

Thèse de doctorat en Médecine. Biologie et sciences de la santé

Sous la direction de Arnaud Bondon.


  • Résumé

    Les osmolytes sont des solutés accumulés dans les cellules de nombreux organismes lors d'une contrainte hyperosmotique pour maintenir le volume cellulaire. Ils peuvent néanmoins induire une inhibition des enzymes dont les bases moléculaires sont au centre de nombreuses études. Nous avons étudié la DHFR, en présence de divers solutés. Les osmolytes ne modifient pas la structure globale de la DHFR et inhibent son activité tout en stabilisant sa structure. Cette inhibition est liée à la diminution du k[indice :]off du produit en présence d'osmolytes. L'étude de la dynamique interne de la DHFR apporte des réponses sur l'origine de l'inhibition de la DHFR en présence d'osmolytes. Une seconde partie présente nos travaux sur la relation structure-activité de peptides antimicrobiens. Ce projet s'inscrit dans la course au développement de nouvelles molécules actives pour substituer les antibiotiques conventionnels. Nous avons déterminé les structures de peptides en environnement membranaire modèle.

  • Titre traduit

    Molecular interactions study by NMR : The DHFR behaviour in presence of osmolytes and pseudopeptides structures in membrane models


  • Résumé

    The osmolytes are small molecules accumulated by cells of a wide variety of organisms in response to hyperosmotic stress to maintain the cellular volume. Nervetheless, enzyme activity is inhibited by these cosolutes and the molecular basis of their effects on the proteins properties is of great interest. We studied the DHFR in presence of the osmolytes. We demonstrate that its overall structure is maintained. While the osmolytes stabilize the DHFR structure, they inhibit its activity at the same time. The k[index :]off, of substrate analogues decreases with increasing the osmolyte concentrations and reflects the variation of DHFR catalytic rate. The study of the DHFR dynamic on several timescales gives answer of the origins of the DHFR inhibition in presence of osmolytes. The second chapter concerns the study of the structure-activity relationship of antimicrobial peptides. The main objective of this project is to develop new drugs. We solved NMR solution structure of in various model membranes.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (283 p.)
  • Notes : Reproduction autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p.137-149, 247-257, 283 (403 réf.)

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université de Rennes I. Service commun de la documentation. Section santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 370050/2009/128/D
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