Identification et caractérisation de la protéine AtNUFIP chez Arabidopsis thaliana / Mise en évidence de son implication dans l'assemblage des complexes sno/scaRNPs et de son impact dans le développement

par Julie Rodor

Thèse de doctorat en Sciences de la vie

Sous la direction de Manuel Echeverria.

Soutenue en 2009

à Perpignan .


  • Résumé

    Chez les eucaryotes, les 2’-O-méthylations et les pseudouridylations sont des modifications post-transcriptionelles majeures des ARNr et snARNs qui sont réalisées par les complexes sno/scaRNPs constitués d’un petit ARN C/D ou H/ACA associé à quatre protéines. L’assemblage des protéines sur le snoARN est une étape importante de la biogenèse des snoRNPs et implique l’intervention de nombreux facteurs dont la protéine NUFIP identifiée chez les animaux et la levure. Au cours de cette thèse, nous avons identifié et caractérisé chez A. Thaliana l’homologue à la protéine NUFIP notamment avec l’étude de mutants d’insertion dans le gène AtNUFIP. Ces analyses ont confirmé l’implication de AtNUFIP dans l’assemblage des complexes C/D snoRNPs à travers son interaction avec la protéine At15,5K. Par contre, AtNUFIP n’est pas nécessaire à l’accumulation des H/ACA snoARNs chez les plantes contrairement aux animaux et la levure. La protéine AtNUFIP est également importante pour l’assemblage des complexes C/D scaRNPs. De plus, nous avons aussi constaté que l’impact de AtNUFIP sur l’accumulation des C/D snoARNs était dépendant de leur organisation génomique. Par ailleurs, les mutants d’insertion atnufip présentent des phénotypes sévères de croissance, de morphologie et de fertilité, ce qui montre l’importance de la protéine AtNUFIP dans le développement. Nous avons également démontré que la réduction dans les mutants atnufip de l’accumulation des C/D snoARNs s’accompagnait d’une réduction du niveau de 2’-O-méthylation associé sur l’ARNr. Les mutants atnufip constituent donc un modèle important pour comprendre l’impact de ces modifications sur le développement d’un organisme complexe

  • Titre traduit

    Identification and characterization of AtNUFIP in Arabidopsis thaliana / Implication in C/D snoRNP and scaRNP assembly and in plant development


  • Résumé

    In eukaryotes, 2’-O-methylations and pseudouridylations are major post-transcriptional modifications that occur on rRNA and snRNA. These modifications are directed by C/D and H/ACA small nucleolar or Cajal body RNA (snoRNA or scaRNA) associated to four core proteins. During the snoRNP biogenesis, the protein assembly on the snoRNA is an important step that requires numerous factors identified in animals and yeast. Among these factors, NUFIP protein plays a critical role in C/D snoRNP biogenesis but is also potentially implicated in H/ACA snoRNP assembly. During this thesis, we have identified and characterized the homologue of NUFIP in A. Thaliana with the study of insertion mutant lines on AtNUFIP gene. Thus, we have confirmed the implication of AtNUFIP in C/D snoRNP assembly through its interaction with At15,5K protein. In contrast, the protein is not essential for H/ACA snoRNA accumulation contrary to what has been observed in animals and yeast. Our study has also revealed the implication of AtNUFIP in the assembly of C/D scaRNP complexes. We have also noticed that the impact of AtNUFIP on C/D snoRNA accumulation is dependent on their genomic organization. Moreover, atnufip mutants present severe phenotypes with clear delay of growth, morphological defects and reduced fertility. These observations indicate the implication of AtNUFIP on plant development. Finally, we have demonstrated that the reduction of the accumulation of the snoRNAs organized in cluster is correlated to a reduced level of 2’-O-methylation on rRNAs. Thus, atnufip mutants constitute an interesting and important model to study the impact of 2’-O-methylation on the development of a complex organism

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Informations

  • Détails : 1 vol. (155 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 123-155

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  • Bibliothèque : Université Perpignan Via Domitia. Service commun de la documentation. Section Lettres et Sciences humaines.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2009 ROD
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