Nouvelles perspectives pour comprendre la reconnaissance des défauts d'empaquetage lipidique par le senseur de courbure membranaire ALPS (Amphipathic Lipid Packing Sensor) : études par dynamique moléculaire

par Paula Gonzalez-Rubio Garrido

Thèse de doctorat en Sciences de la vie

Sous la direction de Catherine Etchebest et de Patrick Fuchs.

Soutenue en 2009

à Paris 6 .


  • Résumé

    Des motifs structuraux largement impliqués dans les processus de modulation de la courbure membranaire sont les hélices amphipathiques. Parmi eux, un senseur de la courbure exhibant des propriétés particulières a été identifiée récemment : ALPS (ArfGAP1 Amphipathic lipid packing sensor). Il a été montré que son interaction avec la membrane était indépendante des charges Žlectrostatiques En effet, le modèle actuel suggère que les résidus hydrophobes soient les responsables de l'ancrage d'ALPS ˆ la membrane en reconaissant les défauts d'empaquetage lipidique. Par simulations par dynamique moléculaire des différentes membranes lipidiques avec le motif ALPS, nous montrons que ce senseur exhibe une considérable liberté conformationnelle et structurelle qui l'habilitent ˆ explorer les défauts d'empaquetage aux niveaux des têtes polaires ainsi qu'au niveau des chaînes aliphatiques. Nous proposons des nouvelles perspectives au niveau atomique de la reconnaissance des défauts d'empaquetage lipidique par ALPS o la déformabilité et flexibilité structurale ainsi que les propriétés dynamiques et physiques de la membrane jouent un r™le prépondérant.

  • Titre traduit

    New perspectives to undestand the lipid packing recognition by the curvature sensor ALPS (amphipathic lipid packing sensor) : molecular dynamics studies


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Informations

  • Détails : 1 vol. (IX-166 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 143-164. 304 réf. bibliogr.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Consultable sur place dans l'établissement demandeur
  • Cote : T Paris 6 2009 441
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