Effets combinés de facteurs climatiques et de la diversité sur le fonctionnement de communautés bactériennes : respiration et métabolomique

par Elsa Coucheney

Thèse de doctorat en Sciences de l'environnement d'Ile de France

Sous la direction de Claire Chenu.

Soutenue en 2009

à Paris 6 .


  • Résumé

    Les sols contiennent deux à trois fois le carbone (C) présent dans l’atmosphère. La plupart des modèles de la dynamique du C prédisent que l’augmentation de la température mènera à une augmentation de la respiration des sols entraînant une rétroaction positive sur le climat. Cependant, la plupart de ces modèles ne considèrent pas explicitement les caractéristiques des communautés microbiennes responsables de la décomposition des matières organiques du sol. De ce fait, l’impact des conditions environnementales sur le fonctionnement microbien et sa régulation par la structure de l’habitat ne sont pas pris en compte. Afin de mieux comprendre comment les interactions entre bactéries d’une communauté sont sensibles aux facteurs climatiques et leurs conséquences sur le fonctionnement microbien, des microcosmes de sable mettant en jeu un gradient de diversité bactérienne ont été incubés pour différentes températures et teneurs en eau en présence d’un substrat simple. La respiration bactérienne a été mesurée et une approche nouvelle en écologie microbienne a également été testée et appliquée à ces microcosmes. Elle consistait à mesurer des profils de métabolites microbiens (‘métabolomique’) permettant une caractérisation plus fine des variations fonctionnelles. Nous avons mis en évidence que (i) l’approche métabolomique représente un outil d’intérêt pour étudier les modifications fonctionnelles au niveau de la population (physiologie) et de la communauté (interactions entre populations), (ii) la sensibilité de la réponse métabolomique à la température d’une population ne semblait pas directement reliée à son affiliation taxonomique et, (iii) la respiration et la métabolomique mettaient en évidence un fonctionnement de communauté mais, (iv) la sensibilité aux facteurs climatiques ne dépendait pas de la diversité de la communauté.

  • Titre traduit

    Impact of bacterial diversity on community response to climatic factors : a microcosms study on microbial respiration and metabolomics


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Informations

  • Détails : 1 vol.([244 p.])
  • Annexes : Bibliogr. p.199-219. 243 réf. bibliogr. Annexes

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Sciences de la Terre Recherche - cartothèque - CADIST.
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  • Cote : T Paris 6 2009 32
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