Contribution à l'étude biochimique et génétique des β-lactamases des bactéries anaérobies et des Aeromonadaceae

Biochemical and genetic characterisation of beta-lactamases of oral anaerobs and Aeromonadaceae

• Auteur / Autrice : Thierry Fosse
• Direction : Pierre Vierling
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Nice
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences fondamentales et appliquées (Nice ; 2000-....)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Fusobacterium

Capnocytophaga

Aéromonas

Enzymes

Clonage

β-lactamases

Résumé

Le but de ce travail a été dans une première partie d’effectuer la caractérisation biochimique et génétique des ß-lactamases des bactéries anaérobies du biofilm de la flore buccale : Prevotella spp. (CfxA2), Capnocytophaga spp. (CfxA3 et SPU-1) et Fusobacterium spp. (FUS-1). La mobilité du gène CfxA2 chez Prevotella sp. Est due à un transposon et au plasmide pCAP01 chez Capnocytophaga ochracea. La deuxième partie a permis de caractériser les ß-lactamases produites par Aeromonas spp. Bactérie ubiquitaire de l’environnement : A. Caviae (CAV-1 progéniteur de la ß-lactamase de type ampCplasmidique FOX-1), A. Enteropelogenes (TRU-1), A. Hydrophila (TEM-24 BLSE plasmidique) et aeromonas media (PER-6 nouvelle BLSE). La distribution des trois types de β-lactamases endogènes (classes B, C et D) était dépendante de l’espèce.

The aim of the first part of this work was to determine the biochemical and genetic characteristics of β-lactamases of anaerobic bacteria isolated from oral flora biofilm : Prevotella spp. (CfxA2), Capnocytophaga spp. (CfxA3 and SPU-1) and Fusobacterium spp. (FUS-1). The mobility of the CfxA2 gene is due to a transposon in Prevotella species gene and to the pCAP01 plasmid in Capnocytophaga ochracea. In contrast, F. Nucleatum polymorphum (FUS-1) and C. Sputigena (SPU-1) β-lactamases seem non transferable and species related. In the second part, we characterized β-lactamases produced by Aeromonas spp. , an ubiquitous environmental bacterium : a. Caviae (CAV-1 the progenitor of FOX-1 a plasmidic ampC type β-lactamase), A. Enteropelogenes (TRU-1), A. Hydrophila (TEMM-24 a plasmidic ESBL) and aeromonas media (PER-6 a new ESBL). The distribution of the 3 types of endogenous β-lactamases (Classes B, C and D) was species dependent.