Recherche de marqueurs génétiques associés à la tolérance/sensibilité des bovins aux trypanosomoses africaines

par Guiguigbaza-Kossigan Dayo

Thèse de doctorat en Biologie. Santé

Sous la direction de Gérard Cuny.

Soutenue en 2009

à Montpellier 2 .


  • Résumé

    L'objectif de cette thèse était d'identifier des marqueurs génétiques associés à la tolérance/sensibilité des bovins aux trypanosomoses africaines. Des analyses d'association entre marqueurs microsatellites et phénotype trypanotolérant (contrôle de l'hématocrite) ont été réalisées sur une population de bovins métis taurins Baoulé/Zébu peul élevés en conditions naturelles au Sud-ouest du Burkina Faso. Les marqueurs microsatellites utilisés étaient localisés dans quatre régions QTL (Quantitative Trait Loci) préalablement identifiés comme liés au contrôle de l'anémie ou de la parasitémie chez des métis N'Dama/zébu Boran. Le déséquilibre de liaison (DL) a été estimé par les mesures D', r' et χ² à partir de données génotypiques et haplotypiques. Les résultats obtenus ont montré une grande diversité génétique en termes de nombre moyen d'allèles par locus, d'hétérozygoties et un faible DL s'étendant sur une courte distance comparativement aux populations bovines européennes sélectionnées. L'ANOVA a montré qu'un allèle du marqueur MNB-42 est significativement associé à ce phénotype (FDR = 0. 011). La recherche de signatures de sélection, effectuée sur des taurins africains trypanotolérants, des zébus africains et des taurins européens trypanosensibles, en utilisant des tests basés sur la réduction de la variabilité des marqueurs microsatellites entre les populations trypanotolérantes et les populations trypanosensibles d'une part et des tests basés sur la différentiation génétique d'autre part, a permis de détecter des marqueurs qui s'écartent de l'hypothèse d'évolution neutre et qui sont donc vraisemblablement liés à des locus sélectionnés. Nos résultats confortent l'hypothèse selon laquelle la sélection naturelle a contribué au développement de la trypanotolérance chez les taurins ouest-africains.

  • Titre traduit

    Search for genetic markers associated with tolerance and/or susceptibility of cattle to African trypanosomosis


  • Résumé

    This thesis aimed at identifying genetic markers associated with tolerance / sensitivity of cattle to African trypanosomosis. Association studies between microsatellite markers and trypanotolerance phenotype (anaemia control) were performed on a crossbred Baoule/zebu peul cattle population in natural conditions in south-western Burkina Faso. For genotyping, we used microsatellite markers located in four QTL (Quantitative Trait Loci) regions previously identified as related to anaemia or parasitaemia control in N'Dama / Boran zebu crossbred population. The linkage disequilibrium (LD) was estimated with D', r' and χ'² measures from genotype and haplotype data. Results showed high genetic variability in terms of mean number of alleles per locus, heterozygosities and the LD extends over shorter distances than what has been observed in selected European bovine populations. The ANOVA test showed that an allele of MNB-42 microsatellite marker was significantly associated with this phenotype (FDR = 0. 011). The search for signatures of selection performed on African trypanotolerant taurine, African trypanosusceptible zebu and European trypanosusceptible taurine, using tests based on the reduction of the microsatellite markers variability between trypanotolerant cattle and trypanosusceptible cattle in one hand and tests based on genetic differentiation on the other hand, allowed the detection of outliers (markers that deviate from the assumption of neutral evolution) that are probably linked to selected loci. Our results support the hypothesis that natural selection contributed to the development of trypanotolerance in West African taurine populations

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Informations

  • Détails : 1 vol. (162 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 138-155. Annexes

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  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS 2009.MON-167
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