Etude cytogénétique et moléculaire de Bos frontalis, Muntiacus vuquangendis et Pseudoryx nghetinhensis (Mammalia, Ruminantia) de la Cordillère Annamitique : implications pour leur conservation

• Auteur / Autrice : Trung Thanh Nguyen
• Direction : Vitaly T. Volobouev
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Zoologie
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
• Jury : Président / Présidente : Bernard Dutrillaux
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Vitaly T. Volobouev, Véronique Barriel, Jiri Rubes, Alexandre Hassanin
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Terence James Robinson, Laurent Granjon, Jan Zima

Mots clés

Mots clés contrôlés

Saola

Muntjac géant

Gaur (mammifère)

Cytogénétique

Biologie moléculaire

Résumé

Nous avons choisi d’étudier trois espèces de ruminants fortement menacées: le saola (Pseudoryx nghetinhensis), le muntjac géant (Muntiacus vuquangensis) et le gaur (Bos frontalis). L’utilisation des approches cytogénétiques et moléculaires nous ont permis de parvenir à une meilleure compréhension de leurs affinités phylogénétiques, de leurs profils d'évolution chromosomique, et de diversité génétique de la population dans le cas du gaur B. Frontalis. Nos résultats suggèrent que le Saola appartient à la sous-tribu des Bubalina, qui contient aussi les genres Bubalus et Syncerus. Le caryotype du muntjac géant M. Vuquangensis a été caractérisé et comparé à 6 autres espèces de la tribu des Muntiacini. L’analyse phylogénétique des données cytogénétiques, en accord avec l’analyse des séquences du génome mitochondrial complet, nous a permis de mettre en évidence l’étroite parenté entre M. Vuquangensis et M. Reevesi. Une analyse utilisant 130 marqueurs microsatellites a été réalisée sur le gaur sauvage afin d’évaluer la diversité génétique de la population présente au Vietnam. Les résultats de cette étude suggèrent un besoin urgent pour une analyse plus détaillée de la diversité génétique des populations de gaurs ainsi que pour l’élaboration d’une stratégie de gestion de ces populations. En conclusion, les résultats cytogénétiques et moléculaires obtenus au cours de ce travail nous ont permis de dégager des grandes lignes directrices pour les politiques de conservation, non seulement pour les trois espèces étudiées mais également pour la conservation ex situ des autres espèces menacées ou en voie d’extinction de la cordillère Annamitique.

The main purpose of the present thesis was to study three highly threatened ruminant species from the Annamites: the saola (Pseudoryx nghetinhensis), the large-antlered muntjac (Muntiacus vuquangensis) and the gaur (Bos frontalis). By using both cytogenetic and molecular approaches, we attempted to gain a deeper understanding of their phylogenetic affinities, patterns of chromosomal evolution and, in the case of the gaur, population genetic diversity. Our phylogenetic analysis of chromosomal data suggests the placement of the saola within the subtribe Bubalina, which contains the species of the genera Bubalus and Syncerus. Second, we studied the karyotype of M. Vuquangensis and compared its banding patterns to those available for six other species of the tribe. Phylogenetic analysis of the chromosome data resulted in the tree fully congruent with that obtained after analysis of the complete mitochondrial genome sequences. Thus both data sets strongly support a close relationship between M. Vuquangensis and M. Reevesi. Third, an analysis of 130 microsatellite markers was undertaken to assess genetic diversity of the wild gaur population in Vietnam. Outcomes of this study suggest an urgent need for further detailed analysis of genetic diversity in gaur populations, and its incorporation in population management strategies. In conclusion, our cytogenetic and molecular information reported herein provide guidelines for further conservation policies not only of species investigated, but also for the ex situ conservation of other threatened and endangered species in the Annamite range.