Analyse génétique de l'embryogenèse somatique chez la chicorée (Cichorium intybus L.) : cartographie des QTL et gènes candidats

par Aline Clabaut

Thèse de doctorat en Ingénierie des fonctions biologiques

Sous la direction de Theo Hendriks.

Soutenue le 24-06-2009

à Lille 1 .


  • Résumé

    L'embryogenèse somatique (ES) est une voie asexuée aboutissant à la formation d'embryons à partir de cellules somatiques qui ressemble à l'embryogenèse zygotique. Chez la chicorée, une variabilité génétique pour ia capacité à former des embryons somatiques in vitro a été mise en évidence et un génotype K59. embryogène et K28. peu embryogène ont été sélectionnés pour obtenir une descendance F1' Cette variabilité a été exploitée afin d'identifier les régions chromosomiques ou QTL et les gènes Impliqués dans l'ES. Après 7 jours d'induction des explants racinaires en condition d'embryogenèse et 30 jours de développement, les plantules issues (PL) du développement des embryons somatiques et les structures chlorophylliennes unipolaires (SH) ont été comptabilisées. Les caractères PL et SH présentent une distribution normale et continue et une héritabilité supérieure à 63%. Une carte génétique issue du croisement K28*K59 a été construite pour la recherche de QTL liée à J'ES. Six QTL ont été identifiés. expliquant plus de 23% et 44% de variation phénotypique totale pour les caractères PL et SH respectivement. Parmi les 63 gènes candidats cartographiés, 16 co-localisent avec les QTL pour PL et SH. La co-localisation de gènes homologues à SHOOT MERISTEMLESS (STM) et ARGONAUTE (AGO) d'Arabidopsis avec les QTL6 et QTL2, respectivement. est particulièrement intéressante. En effet. ces gènes sont connus pour leur implication dans la maintenance de l'état dédifférencié des cellules souches dans le méristème caulinaire. Avec la détection des QTL pour l'ES. les résultats de cette étude ont fourni pour la première fois des éléments sur le contrôle génétique de l'ES chez la chicorée.

  • Titre traduit

    Genetic analysis of somatic embryogenesis in chicory (Cichorium intybus L.) : qTL mapping and candidate genes


  • Résumé

    Somatic embryogenesis (SE) Is an asexual re-production pathway in which somatic cells form embryos in a process that resembles zygotic embryogenesis. ln chicory a genetic variability in the capacity of somatic embryo formation was found, and two contrasting genotypes were selected K59, embryogenic. and K28, hardly embryogenic were selected for obtain a F1' progeny. Vanabllity for somatic embryo formation was exploited to identify chromosomal regions (QTL) and candidate genes implicated in ES. After 7 days of culture of root explants under SE-inducing conditions and 30 days of development the number of plantlets (PL) and shoot-like structures (SH) obtained were counted. The traits PL and SH showed continuous and normal distributions after log10 transformation, and heritabilities superior to 63%. A genetic map for the K28*K59 progenies was built for a QTL analysis related to ES. Six QTL were detected for both PL and SH that together explained more than 23% and 44% of the phenotypic variation for these traits. respectively. Amongst the 63 mapped candidate genes, 16 co-Iocalised with QTL for PL and SH. ln view of their implication in the maintenance of the undifferentiated state of the stem ceIls in shoot apical meristems. the co-localisation of genes homologous to SHOOT MERISTEMLESS (STM) and ARGONAUTE (AGO) in Arabidopsis wlth QTL6 and QTL2. respectively. is a particular interesting result. With the detection of QTL for SE. the results of this study have for the first time revealed elements in the genetic control of SE in chicory.


Il est disponible au sein de la bibliothèque de l'établissement de soutenance.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université des sciences et technologies de Lille. Service commun de la documentation. Bibliothèque virtuelle.
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.