Analyse de la diversité génétique et symbiotique des populations naturelles tunisiennes de Medicago truncatula et recherche de QTL liés au stress salin

par Fatma Lazrek-Ben Friha

Thèse de doctorat en Biologie

Sous la direction de Thierry Huguet et de Mohamed Elarbi Aouani.

Soutenue en 2008

à Toulouse 3 .


  • Résumé

    L'objectif de cette thèse est l'étude de la diversité génétique au sein de 136 lignées appartenant à 10 populations naturelles tunisiennes de M. Truncatula. Ces populations proviennent de différentes conditions pédoclimatiques représentatives du territoire tunisien. La première partie consiste à une analyse à l'échelle moléculaire par l'utilisation de 18 microsatellites répartis sur les différents groupes de liaison. Cela a permis de structurer les populations selon un axe nord / sud séparé par la dorsale tunisienne. Le paramètre pluviométrie est le principal facteur influençant cette structuration. De même l'utilisation de marqueurs morphologiques a permis d'approfondir la caractérisation des populations et de la comparer à celle obtenue par les microsatellites. Dans une seconde partie, on a poursuivi l'analyse de la diversité par l'étude de la variabilité de croissance d'un certain nombre de lignées, sous alimentation azotée et en symbiose avec différentes souches de Rhizobium, en absence ou en présence de stress salin. A partir de cette analyse, on a pu sélectionner des couples de lignées contrastants pour leur réponse au sel dans ces deux conditions étudiées qui nous ont permis d'identifier des critères de tolérance au sel. La dernière partie concerne une analyse quantitative visant essentiellement à identifier des marqueurs impliqués dans la tolérance à la salinité chez le partenaire végétal. On a utilisé la descendance d'un croisement disponible au laboratoire entre deux lignées de référence Jemalong et F83005. 5. . . .

  • Titre traduit

    Genetic and symbiotic diversity for tunisisan natural populations of Medicago truncatula


  • Résumé

    The objective of this thesis is to study genetic diversity within 136 lines belonging to Tunisian 10 natural populations of M. Truncatula. These populations come from different soil and climatic conditions, representative of the Tunisian territory. The first part consists of an analysis at the molecular level by the use of 18 microsatellites spread over different linkage groups. That helped to structure populations depending to a north / south axis separated by the Tunisian Dorsale. The parameter rainfall is the most important factor influencing this structure. Similarly, using morphological markers, we tried to deepen the characterization of populations and to make comparison with that obtained by microsatellites. In the second part, we continued the analysis of the diversity by the study of the variability of a number of lines under nitrogen assimilation or in symbiosis with different strains of Rhizobium, in the presence or absence of salt stress. Based on this analysis, it was possible to select pairs of contrasting lines for their response to salt in those two conditions studied, which have enabled us to identify criteria for salt tolerance. The last part involves a quantitative analysis which aimed primarily to identify markers involved in salt tolerance in the plant partner. . . .

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Informations

  • Détails : 1 vol. (254 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 215-226

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 2008TOU30199
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