?valuation de l'a?rocontamination fongique dans les environnements int?rieurs

par Ad?la?de Nieguitsila

Thèse de doctorat en Parasitologie-Mycologie

Sous la direction de Jacques Guillot et de Sophie Latouche-Cottenot.

Soutenue le 26-06-2008

à Paris Est , dans le cadre de Ecole doctorale Sciences de la Vie et de la Sant? (Cr?teil ; 2010-2015) , en partenariat avec Biologie mol?culaire et immunologie parasitaires et fongiques (équipe de recherche) et de Biologie mol?culaire et immunologie parasitaires et fongiques (laboratoire) .


  • Résumé

    Le contr?le de l?a?rocontamination fongique est devenu un objectif majeur pour pr?server la sant? humaine et animale. L??valuation de l?a?rocontamination fongique fait classiquement appel aux techniques de mise en culture ou de dosage de composants fongiques pr?sents dans l?air. Ces techniques pr?sentent des inconv?nients. C?est la raison pour laquelle, nous nous sommes fix?s comme objectif de mettre au point des m?thodes d?analyse alternatives utilisant des outils de biologie mol?culaire. Dans un premier temps, nous avons compar? plusieurs techniques de pr?l?vements d?air dans des environnements int?rieurs pr?sentant une contamination plus ou moins ?lev?e. Nous avons, par la suite, optimis? les conditions d?extraction de l?ADN fongique ? partir de pr?l?vements d?air. L?ADN extrait a ?t? amplifi? par PCR ? semi-nich?e ? avec des amorces universelles permettant d?amplifier une partie de l?ARNr 18S de champignons. Par la suite, nous avons utilis? la TTGE (Temporal Temperature Gradient Electrophoresis) et la D-HPLC (Denaturing High Performance Liquid Chromatography) pour s?parer les amplificats. Chaque produit de PCR a ?t? identifi? par s?quen?age direct apr?s purification. La comparaison des esp?ces identifi?es par ces techniques avec celles qui sont obtenues par la m?thode classique (culture) apporte de meilleurs renseignements sur la qualit? fongique d?un m?me pr?l?vement d?air. L?application de ces techniques dans des environnements ? diff?rents niveaux de contamination a permis de d?duire que l??tude de l??valuation de l?a?rocontamination fongique se fait par l?association de la culture et des m?thodes mol?culaires

  • Titre traduit

    Evaluation of fungal aerocontamination in indoor environments


  • Résumé

    Fungal spores represent a significant part of the biological contaminants that could be detected in air. Exposure to fungi has been associated with several types of human or animal health problems (mycosis, allergy, mycotoxicosis). To evaluate the relationship between airborne fungi potential and adverse health effect, the fungal types and their relative frequencies in air need to be investigated. Traditional methods for fungal identification (culture and microscopy analysis) are laborious, time-consuming and require expertise. To replace cultivation, several techniques have been proposed. This study showed that molecular techniques (PCR-TTGE or Temporal Temperature Gradient Electrophoresis and PCR-DHPLC or Denaturing High Performance Liquid Chromatography) allowed the separation of amplificons corresponding to distinct fungal species that may be encountered in air. Both methods were proved to be appropriate for analysis of complex fungal communities. The detection and the molecular identification techniques were adapted for the evaluation of indoor airborne fungal contamination. The cultivation method and culture-independent techniques were further compared for the analysis of fungal aerosols from different sites


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