Diversit?, origine et caract?risation de la mycoflore des meules de Macrotermitinae (Isoptera, Termitidae)

par Herbert Joseph Guedegbe

Thèse de doctorat en ?cologie microbienne

Sous la direction de Corinne Rouland-Lef?vre.

Soutenue le 25-09-2008

à Paris Est , dans le cadre de Ecole doctorale Sciences de la Vie et de la Sant? (Cr?teil ; 2010-2015) , en partenariat avec Biodiversit? et fonctionnement des sols (équipe de recherche) et de Laboratoire d'?cologie des sols tropicaux interactions macrofaune-microflore (laboratoire) .


  • Résumé

    La diversit? fongique des meules de plusieurs esp?ces de Macrotermitinae a ?t? analys?e au niveau taxinomique, fonctionnel et g?n?tique ? l?aide d?une approche polyphasique associant plusieurs techniques compl?mentaires. L?objectif ?tant d??valuer la sp?cificit? des taxons fongiques associ?s aux meules ainsi que les relations qu?ils entretiennent avec les termites champignonnistes. Une grande vari?t? de phylotypes cultivables appartenant majoritairement au phylum des Ascomyc?tes a ?t? obtenue par isolement et s?quen?age des ITS fongiques, et peu de s?quences se sont r?v?l?es ?tre sp?cifiques ? un genre de Macrotermitinae particulier. Les profils physiologiques obtenus ont mis en ?vidence la nature saprophytique de la majorit? des phylotypes et confirm? l?absence de taxons sp?cifiques. Par PCR-DGGE de l?ADN total de meules, 100% des phylotypes ITS et 28S fongiques identifi?s ?taient affili?s au genre Termitomyces. La technique Suicide Polymerase Endonuclease Restriction (SuPER) a ?t? adapt?e ? la mycoflore des meules pour limiter l?impact de l?ADN majoritaire du Termitomyces symbiotique. Celle-ci a permis la d?tection de plusieurs autres populations fongiques. Les analyses phylog?n?tiques ont montr? d?une part la sp?cificit? des Xylaria associ?s aux meules de Macrotermitinae bien qu?aucune co-?volution n?ait ?t? observ?e avec les termites h?tes et d?autre part leur affiliation dans un sous-genre sp?cifique. Une analyse pr?liminaire des facteurs d?inhibition a ?galement r?v?l? l?implication des termites dans la r?gulation des communaut?s fongiques des meules. Dans leur ensemble, nos r?sultats illustrent clairement l?influence des Macrotermitinae sur les communaut?s fongiques telluriques pendant leurs diff?rentes activit?s.

  • Titre traduit

    Diversity, origin and characterisation of fungal communities associated to fungus-growing termite (Isoptera, Termitidae) combs


  • Résumé

    Fungal diversity of several Macrotermitinae fungus combs was analyzed at taxonomic, functional and genetic levels using a polyphasic approach. The aim of this thesis was to evaluate the specificity of fungal strains from combs and to elucidate their relationship with fungus-growing termites. A large variety of culturable phylotypes mainly belonging to Ascomycota phylum was retrieved using conventional isolation techniques followed by sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region. Based on the obtained results, there is evidence for any speciesspecificity between these taxa and a given genus of Macrotermitinae. This finding was supported by the physiological profile of some representative phylotypes which revealed the saprophytic nature of most of the isolates. By PCR-DGGE analysis of fungal ITS and LSU, all of the sequences were belonged to Termitomyces genus. The Suicide Polymerase Endonuclease Restriction method was adapted to the analysis of comb mycoflora for restricting the impact of the dominant Termitomyces DNA. As expected, this latter technique revealed non-Termitomyces fungal populations. Phylogenetic analysis also showed the specificity of termiteassociated Xylaria although they do not evolved with termite hosts, and also their affiliation to a new genus or at least a specific sub-genus. Preliminary investigation revealed the implication of termite workers in fungal regulation in fungus combs. All in one, our results clearly underline the great impact of fungus-growing termite species on soil fungal community during their activities.


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