Activité de l'élément transposable mariner dans des populations naturelles de Drosophila simulans

par Sophie Picot

Thèse de doctorat en Sciences biologiques. Sciences de la vie

Sous la direction de Pierre Capy et de Aurélie Hua-Van.


  • Résumé

    Cette thèse porte sur l’élément transposable de classe II mariner. Nos travaux tirent parti d’un test phénotypique, permettant d’estimer dans l’espèce Drosophila simulans le niveau d’activité des copies mariner. Dans les populations naturelles, on observe un nombre variable de copies, dont certaines capables de transposer. La première partie porte sur la distribution à travers le monde du niveau d’activité mariner des populations naturelles. Une étude précédente montrait un clîne d’activité lié à la latitude et suggérait un impact de la température, mais cette relation a été remise en cause. Nous proposons une nouvelle interprétation, basée sur l’histoire invasive de l’espèce D. Simulans. La seconde partie porte sur l’élément mariner dans deux populations naturelles. Nous avons en particulier recherché des effets maternels et grand-maternels, correspondant à la transmission maternelle de transposase. De tels effets n’ont pas été mis en évidence. Au contraire, nos analyses suggèrent l’existence d’une répression transmise maternellement dans la population Dr04. Cette proposition, qui demande confirmation, se base sur le modèle du trans-silencing effect mis en évidence pour l’élément P. De plus, le contenu en élément mariner de l’une des populations (Dr04) a été étudié. Il existe un important polymorphisme d’insertion, qui explique probablement la variabilité de l’activité. Une quarantaine de copies ont été identifiées, dont plus de la moitié pourrait potentiellement coder une transposase fonctionnelle. De plus, la moitié des copies serait aussi mobilisable. Certaines copies avec des transposases tronquées ou mutées pourraient être impliquées dans des régulations.

  • Titre traduit

    Activity of the mariner transposable element in natural populations of Drosophila simulans


  • Résumé

    This thesis focuses on the class-II transposable element called mariner. Our studies use a phenotypical test available for the Drosophila simulans species that allow us to estimate the level of activity of the mariner copies. In the natural populations of this species, there is a variable number of mariner copies, some of them able to transpose. The first part of this work is about the worldwide distribution of the level of mariner activity in natural populations. A previous study discovered a cline of the level of activity with latitude, and suggested that temperature would have an impact, but a latter study belied these results. We now propose a new interpretation, based on the invasive history of the D. Simulans species. In the second part, we study the mariner element in two natural populations. We especially investigated the existence of maternal and grand-maternal effects corresponding to maternal transmission of transposase. Such effect cannot be found in our populations. On the contrary our results suggest that a maternally transmitted repression exists in the Dr04 population. The proposed model is based on the trans-silencing effect discovered for the P element. We also studied the mariner content of one of the populations. It shows an important insertional polymorphism, which would explain the variability of the mariner activity. About forty copies were identified. More than half of them would code a full-length and potentially functional transposase. Besides, half of the copies could be mobilized (able to transpose). Also some copies, that have a truncated or a muted transposase, could take part in auto-regulations.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (245 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 219-228. Index

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(2008)169
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